[发明专利]基于gp5.5蛋白质的大肠杆菌总tRNA纯化方法有效
| 申请号: | 201810529427.9 | 申请日: | 2018-05-29 |
| 公开(公告)号: | CN108676793B | 公开(公告)日: | 2020-07-10 |
| 发明(设计)人: | 朱斌;夏恒;黄锋涛;吴慧;陆雪玲;闫艳;余兵兵 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学;深圳华中科技大学研究院 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C07K14/01;C07K19/00 |
| 代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 徐瑛 |
| 地址: | 430075 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 gp5 蛋白质 大肠杆菌 trna 纯化 方法 | ||
1.一种gp5.5蛋白质在分离纯化大肠杆菌总tRNA中的应用,其特征在于,所述gp5.5蛋白质来自T7噬菌体基因5.5编码的小蛋白质,所述gp5.5蛋白质的氨基酸序列为序列表SEQID NO.4所示的第17-115位。
2.根据权利要求1所述的一种gp5.5蛋白质在分离纯化大肠杆菌总tRNA中的应用,其特征在于,所述gp5.5蛋白质氨基端加有蛋白标签,所述蛋白标签与gp5.5蛋白质之间由0~10个氨基酸组成保持柔性的肽段连接。
3.根据权利要求2所述的一种gp5.5蛋白质在分离纯化大肠杆菌总tRNA中的应用,其特征在于,所述蛋白标签为FLAG标签、HA标签、SBP标签、Avi标签、Nus标签、V5标签、MBP标签中的一种。
4.根据权利要求2所述的一种gp5.5蛋白质在分离纯化大肠杆菌总tRNA中的应用,其特征在于,所述gp5.5蛋白质为T7噬菌体基因组中核酸代谢区域基因表达的蛋白质,所述蛋白标签为组氨酸标签,所述组氨酸标签的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述组氨酸标签与所述gp5.5蛋白质之间的连接肽段由10个氨基酸组成,所述连接肽段的氨基酸序列如序列表SEQ ID NO.3所示,携带序列表SEQ ID NO.2所示组氨酸标签及序列表SEQ ID NO.3所示连接肽段的gp5.5蛋白质的氨基酸序列如序列表SEQ ID NO.4所示。
5.基于gp5.5蛋白质的大肠杆菌总tRNA纯化方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1在大肠杆菌中过表达权利要求1中所述的gp5.5蛋白质并通过镍柱纯化获得gp5.5蛋白质的洗脱液,所述纯化获得的gp5.5蛋白质结合有tRNA;
S2.纯化gp5.5蛋白质结合的tRNA。
6.根据权利要求5所述的基于gp5.5蛋白质的大肠杆菌总tRNA纯化方法,其特征在于,所述步骤S1的具体流程为:
a、细菌裂解:将菌体重悬于裂解液中,冷冻凝固后取出融化,置于冰上裂解1小时,接着再反复冻融两次;离心30分钟后将上清液过滤去除杂质;
b、镍柱纯化:在gp5.5蛋白质氨基端加上蛋白标签,使所述步骤a中得到的去除杂质的上清液通过镍柱,利用镍柱亲和层析在无RNA酶的环境下对表达的gp5.5蛋白质进行纯化,加入咪唑浓度由低到高的洗脱液洗脱镍柱,收集含gp5.5蛋白质的洗脱液;所述蛋白标签为组氨酸标签、FLAG标签、HA标签、SBP标签、Avi标签、Nus标签、V5标签、MBP标签中的一种。
7.根据权利要求5所述的基于gp5.5蛋白质的大肠杆菌总tRNA纯化方法,其特征在于,所述步骤S2的具体流程为:酚氯仿法纯化与gp5.5蛋白质结合的tRNA:按照体积比为3:1的比例将苯酚试剂溶液加入步骤S1收集含gp5.5蛋白质的洗脱液中,激烈震荡15-20秒,加入占苯酚溶液1/5体积的氯仿,再次剧烈震荡15-20秒,静置,离心,吸取上层水相溶液并加入1/10体积的3M NaAc,混匀后加入2.5倍体积预冷的无水乙醇,混匀后静置,离心;倒掉上清后加入80%体积的预冷无水乙醇,离心,倒掉上清,晾干后保存或加入适量体积的DEPC水溶解后保存。
8.根据权利要求5所述的基于gp5.5蛋白质的大肠杆菌总tRNA纯化方法,其特征在于,所述步骤S2还可以采用凝胶纯化法提取gp5.5蛋白质结合的tRNA,具体步骤为:
(1)将步骤S1收集的含gp5.5蛋白质的洗脱液按照体积比6:1的比例加入6×核酸上样缓冲液,90℃变性1分钟后置于冰上,通过TBE尿素变性胶凝胶电泳,切胶回收tRNA目的条带;加入1-2倍凝胶体积的凝胶洗脱缓冲液,并将胶捣碎后室温旋转洗脱过夜,过滤除去凝胶碎块,得到过滤液;
(2)在上述步骤(1)的过滤液中加入1/10体积3M NaAc混匀后再加入2.5倍体积的预冷无水乙醇,静置,离心;倒掉上清后加入80%体积的预冷无水乙醇,离心,倒掉上清,晾干后加入适量体积的DEPC水溶解后保存。
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