[发明专利]短体副鳅微卫星位点及其引物和应用有效
| 申请号: | 201810382671.7 | 申请日: | 2018-04-26 |
| 公开(公告)号: | CN108559782B | 公开(公告)日: | 2020-05-19 |
| 发明(设计)人: | 李伟涛;阙延福;熊美华;邵科;廖小林;朱滨 | 申请(专利权)人: | 水利部中国科学院水工程生态研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 42102 | 代理人: | 徐晓琴 |
| 地址: | 430079 湖北省*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 短体副鳅微 卫星 及其 引物 应用 | ||
1.短体副鳅的微卫星分子标记,其特征在于,包括7个微卫星分子标记,所述微卫星分子标记的核酸序列如SEQ ID NO:1~7所示。
2.用于扩增权利要求1所述短体副鳅微卫星分子标记的引物对,其特征在于,核苷酸序列如SEQ ID NO:8~21所示;用于扩增序列为SEQ ID NO:1的微卫星分子标记的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9;用于扩增序列为SEQ ID NO:2的微卫星分子标记的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11;用于扩增序列为SEQ IDNO:3的微卫星分子标记的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13;用于扩增序列为SEQ ID NO:4的微卫星分子标记的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15;用于扩增序列为SEQ ID NO:5的微卫星分子标记设计的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17;用于扩增序列为SEQ ID NO:6的微卫星分子标记设计的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19;用于扩增序列为SEQ IDNO:7的微卫星分子标记设计的引物对,其上下游序列分别为SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21。
3.权利要求1所述短体副鳅的微卫星分子标记在短体副鳅的种群遗传学、家系鉴定和分子标记辅助育种方面的应用。
4.权利要求2所述短体副鳅微卫星分子标记引物对在短体副鳅的种群遗传学、家系鉴定和分子标记辅助育种方面的应用。
5.根据权利要求4所述应用,其特征在于,利用权利要求2所述短体副鳅微卫星分子标记引物对检测短体副鳅种群遗传多样性,包括如下步骤:
(1)基因组DNA的提取:采用酚氯仿法提取短体副鳅鳍条组织的基因组DNA;
(2)微卫星PCR扩增:利用短体副鳅微卫星分子标记引物对,以短体副鳅鳍条组织的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得微卫星扩增产物;
(3)测序仪检测扩增产物:将扩增产物避光保存,在ABI 3730XL测序仪进行毛细管电泳和STR分析;
(4)遗传多样性分析:根据每个个体微卫星扩增产物的分子量大小确定基因型,采用GENEPOP 4.0.10计算遗传多样性参数。
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