[发明专利]细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法及其引物和探针在审
| 申请号: | 201810122147.6 | 申请日: | 2018-02-07 |
| 公开(公告)号: | CN110117664A | 公开(公告)日: | 2019-08-13 |
| 发明(设计)人: | 吴姗;董强;虞惠贞 | 申请(专利权)人: | 福建译宁科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京京万通知识产权代理有限公司 11440 | 代理人: | 万学堂 |
| 地址: | 350400 福建省福州市平潭综合实*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 探针 引物 实时荧光PCR 荧光PCR检测 检测结果 成分检测 扩增反应 样品特性 灵敏度 有效地 预设 判定 物种 | ||
1.一种细鳞壮鳕的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针由下表中的序列组成:
其中,AP-F表示上游引物;AP-R表示下游引物;AP-P表示探针。
2.一种细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,至少包括如下步骤:
S1:设计细鳞壮鳕的引物和探针,所述引物和探针至少由下表中的一种组成:
其中,AP-F表示上游引物;AP-R表示下游引物;AP-P表示探针;
S2:提取细鳞壮鳕样品中的DNA;
S3:根据所述引物和探针及DNA,进行实时荧光PCR扩增反应,获得检测结果;
S4:将检测结果与预设的Ct值比较,判定样品特性。
3.根据权利要求2所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,所述上游引物的浓度为10pmol/μL,下游引物的浓度为10pmol/μL,探针的浓度为10pmol/μL。
4.根据权利要求3所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤S2具体为:
S21:获取0.2g细鳞壮鳕样品,并在液氮中研磨;
S22:使用DNA抽提试剂盒进行DNA抽提;
S23:将抽提后的DNA溶解在100μL水中,获得DNA液。
5.根据权利要求4所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤S3具体为:
S31:获取10μL的Premix Ex Taq,0.4μL的上游引物,0.4μL的下游引物,0.4μL的探针以及1μL的DNA液,并加水补足至20μL;
S32:使用实时荧光PCR仪进行实时荧光PCR扩增反应,其中实时荧光PCR扩增反应的程序如下:
95℃预变性10sec;95℃变性5sec;60℃退火并延伸23sec,执行40个循环,在每个循环的60℃退火并延伸阶段收集荧光信号,以获得检测结果。
6.根据权利要求5所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,在步骤S3后,还包括步骤S30:设置阳性对照、阴性对照及提取空白对照。
7.根据权利要求6所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,在步骤S4之前,还包括步骤S40:获取真核生物的引物和探针,并作为内参照引物和探针;其中真核生物的引物和探针由下表中的序列组成:
其中18SrRNA-F表示上游引物,18SrRNA-R表示下游引物,18SrRNA-P表示探针。
8.根据权利要求7所述细鳞壮鳕的荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤S4具体为:
S41:若检测结果显示空白对照、阴性对照无FAM荧光信号,阳性对照Ct值小于等于30,则判定实时荧光PCR扩增反应有效,否则反应无效;
S42:在实时荧光PCR扩增反应有效的前提下,用内参照引物探针筛选出Ct值≤30的样品;
S43:在Ct值≤30的样品中的特异性曲线出现扩增曲线时,则表示DNA抽提有效,否则应重新提取DNA,直至Ct值≤30;
S44:在实时荧光PCR扩增反应有效,且抽提的DNA有效的情况下,细鳞壮鳕的特异性引物探针检测得到的Ct值≤35时,则判断样品为阳性,若Ct值>35,则判断样品为阴性。
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