[发明专利]多试验处理和分析的方法和系统

说明书

本公开提供了多试验处理和多试验分析的方法。这种多试验处理和分析涉及靶核酸的自动检测，例如，如在临床环境下为诊断目的进行的。也提供了通用试验定时方案，其源自各种个体核酸扩增和分析方案并且经修改，以防止资源冲突。本公开也提供了用于实施如本文所描述的方法的系统和设备。

相关申请的交叉引用

根据35美国C.§119(e)，本申请要求于2016年3月15日提交的美国临时专利申请系列号62/308,625申请日的优先权，该申请的内容通过引用并入本文。

背景技术

分子诊断试验，包括基于核酸扩增的方法已经成为临床医学和各种可用测试的支柱并且临床医生对于这种测试的需求急剧增加。这种需求使临床实验室处理的压力增大，不仅仅要处理大量样品，而且还要对样品进行各种测试。因此，对临床测试设施有效进行更宽范围的基于不同核酸扩增的测试造成了负担。

试验方案限定了通过自动化仪器处理样品需要的所有试剂、处理步骤、处理时间、温度曲线等，以便获得诊断结果。历史上，为每类试验开发了包含不同试剂、步骤和时间的独特试验方案，以便优化试验表现。对于以批次模式处理样品的仪器，其中每轮仅处理一类试验，独特的试验方案不影响总体系统吞吐量和调度复杂性，因为方案对于该批次中进行的所有样品是相同的。但是，在每轮同时处理多试验类型的仪器的情况下，独特的试验方案对于调度程序复杂性和系统资源的有效使用具有显著影响。

发明内容

本公开的方面包括用于多试验处理的方法以及多试验量化和多试验处理系统。

本公开的方面包括多试验处理的方法，其包括：a)为两个或更多个不同靶核酸检测试验的每个制备样品处理单元(SPU)架；b)将样品上样至每个制备的SPU筒；c)处理每个上样的SPU筒，为两个或更多个不同靶核酸检测试验的每个分离样品核酸；以及d)为对于两个或更多个不同靶核酸检测试验的每个具有特异性的靶核酸扩增和分析每个样品核酸，其中方法包括步骤a)至d)中的或步骤a)至d)之间的至少一个延迟步骤，并且步骤a)至d)各自为两个或更多个不同靶核酸检测试验进行相同的一段时间。在一些情况下，方法的方面包括步骤a)和b)之间的延迟步骤，步骤b)和c)之间的延迟步骤和/或步骤c)和d)之间的延迟步骤。

在一些情况下，方法的方面包括在制备之前，将两个或更多个不同靶核酸检测试验的每个使用的冻干试剂再水化，其中对于两个或更多个不同靶核酸检测试验，再水化进行相同的一段时间。在一些情况下，方法的方面包括再水化之后的延迟步骤。

在一些情况下，方法的方面包括在处理之前，预处理每个上样的SPU筒，其中对于两个或更多个不同靶核酸检测试验，预处理进行相同的一段时间。在一些情况下，方法的方面包括预处理之前的延迟步骤。

在一些情况下，方法的方面包括其中预处理包括使样品接触蛋白酶。

在一些情况下，方法的方面包括其中处理包括将样品转移至包括裂解缓冲液的溶液中，其中对于两个或更多个不同靶核酸检测试验，转移进行相同的一段时间。在一些情况下，方法的方面包括转移之后的延迟步骤。

在一些情况下，方法的方面包括其中处理包括洗脱核酸和将洗脱的核酸转移至用于扩增和分析的反应容器中，其中对于两个或更多个不同靶核酸检测试验，洗脱进行相同的一段时间。在一些情况下，方法的方面包括洗脱之后的延迟步骤。