[发明专利]依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因多态性检测试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 201711162219.1 申请日: 2017-11-21
公开(公告)号: CN109811054A 公开(公告)日: 2019-05-28
发明(设计)人: 田晓丽 申请(专利权)人: 宁波美丽人生医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 315800 浙江省宁波*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 疗效相关基因 替尼泊苷 依托泊苷 试剂盒 基因多态性检测 检测 多态性检测 基因多态性 检测引物 特异性强 灵敏度 内控 引物
【权利要求书】:

1.一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测试剂盒,该试剂盒用于检测基因多态性的引物包括:

CYP3A4(352):5′-GGATTTATGAGAAGTGGCA-3′SEQ ID NO:1

5′-GGATTTATGAGAAGTGTCG-3′SEQ ID NO:2

5′-CCTGTCCCCACCAGATTC-3′SEQ ID NO:3

MDR1(3435):5′-CCTTTGCTGCCCTAACG-3′SEQ ID NO:4

5′-TCCTTTGCTGCCCTAACA-3′SEQ ID NO:5

5′-GAATGTTCAGTGGCTCCGA-3′SEQ ID NO:6

内控:5’-AGCAAGCAGGAGTATGACG-3'SEQ ID NO:7

5'-GAAAGGGTGTAACGCAACT-3'SEQ ID NO:8 。

2.如权利1要求所述的依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述PCR缓冲液包括3’→5’外切酶活性高保真Taq酶,1.0-5.0mM的MgCl2,1.0-5.0mM的dNTPs,即dATP、dUTP、dGTP、dCTP各1.0-5.0mM以及SYBR Green I。

3.一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,包括以下步骤:

(1)提供如权利要求1中所述的引物;

(2)待测样品的处理和模板的提取;

(3)配制荧光定量PCR反应体系及条件;

(4)利用ARMS引物区分野生型和突变型基因序列,通过SYBR GREEN染料和扩增产物的杂交,检测反应体系的SYBR荧光强度来判定检测结果。SYBR为检测信号,以SYBR信号达到设定的阈值所需的的循环次数Ct值作为判断标准,Ct值小于32为阳性,Ct值大于35为阴性,Ct值介于32到35之间为弱阳性。

4.如权利3所述的一种检测依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性的方法,其特征在于:步骤(2)所述的待测样品包括手术切除的新鲜病理组织,甲醛固定石蜡包埋的病理组织,石蜡切片,全血,血浆,血清,胸腔积液。

5.如权利1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性对照液和阴性对照液;

所述阳性对照液为含有试剂盒内可检测的4个位点对应的质粒混合液,所述4种质粒分别含有4种不同的带有待检测突变位点的CYP3A4和MDR1等位基因;所述质粒浓度为1000copies/μl;

所述阴性对照液为Tris-HCL缓冲液,所述的Tris-HCL缓冲液的浓度为7-13mM,pH为7.5-8.5。

6.如权利3要求所述的一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的PCR体系中各组分终浓度及含量如下:

7.如权利3要求所述的一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的PCR反应条件为:

95℃ 15分钟,40个循环:95℃ 10秒,60℃ 30秒。

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