[发明专利]依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因多态性检测试剂盒及检测方法在审
| 申请号: | 201711162219.1 | 申请日: | 2017-11-21 |
| 公开(公告)号: | CN109811054A | 公开(公告)日: | 2019-05-28 |
| 发明(设计)人: | 田晓丽 | 申请(专利权)人: | 宁波美丽人生医学检验所有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 315800 浙江省宁波*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 疗效相关基因 替尼泊苷 依托泊苷 试剂盒 基因多态性检测 检测 多态性检测 基因多态性 检测引物 特异性强 灵敏度 内控 引物 | ||
1.一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测试剂盒,该试剂盒用于检测基因多态性的引物包括:
CYP3A4(352):5′-GGATTTATGAGAAGTGGCA-3′SEQ ID NO:1
5′-GGATTTATGAGAAGTGTCG-3′SEQ ID NO:2
5′-CCTGTCCCCACCAGATTC-3′SEQ ID NO:3
MDR1(3435):5′-CCTTTGCTGCCCTAACG-3′SEQ ID NO:4
5′-TCCTTTGCTGCCCTAACA-3′SEQ ID NO:5
5′-GAATGTTCAGTGGCTCCGA-3′SEQ ID NO:6
内控:5’-AGCAAGCAGGAGTATGACG-3'SEQ ID NO:7
5'-GAAAGGGTGTAACGCAACT-3'SEQ ID NO:8 。
2.如权利1要求所述的依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述PCR缓冲液包括3’→5’外切酶活性高保真Taq酶,1.0-5.0mM的MgCl2,1.0-5.0mM的dNTPs,即dATP、dUTP、dGTP、dCTP各1.0-5.0mM以及SYBR Green I。
3.一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,包括以下步骤:
(1)提供如权利要求1中所述的引物;
(2)待测样品的处理和模板的提取;
(3)配制荧光定量PCR反应体系及条件;
(4)利用ARMS引物区分野生型和突变型基因序列,通过SYBR GREEN染料和扩增产物的杂交,检测反应体系的SYBR荧光强度来判定检测结果。SYBR为检测信号,以SYBR信号达到设定的阈值所需的的循环次数Ct值作为判断标准,Ct值小于32为阳性,Ct值大于35为阴性,Ct值介于32到35之间为弱阳性。
4.如权利3所述的一种检测依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性的方法,其特征在于:步骤(2)所述的待测样品包括手术切除的新鲜病理组织,甲醛固定石蜡包埋的病理组织,石蜡切片,全血,血浆,血清,胸腔积液。
5.如权利1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性对照液和阴性对照液;
所述阳性对照液为含有试剂盒内可检测的4个位点对应的质粒混合液,所述4种质粒分别含有4种不同的带有待检测突变位点的CYP3A4和MDR1等位基因;所述质粒浓度为1000copies/μl;
所述阴性对照液为Tris-HCL缓冲液,所述的Tris-HCL缓冲液的浓度为7-13mM,pH为7.5-8.5。
6.如权利3要求所述的一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的PCR体系中各组分终浓度及含量如下:
7.如权利3要求所述的一种依托泊苷/替尼泊苷疗效相关基因(CYP3A4和MDR1)基因多态性检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中的PCR反应条件为:
95℃ 15分钟,40个循环:95℃ 10秒,60℃ 30秒。
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