[发明专利]用于溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的多重检测的核酸、试剂盒及方法有效
申请号: | 201711046205.3 | 申请日: | 2017-10-31 |
公开(公告)号: | CN107541560B | 公开(公告)日: | 2020-06-16 |
发明(设计)人: | 李伟;张翠萍 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6895;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 北京易捷胜知识产权代理事务所(普通合伙) 11613 | 代理人: | 齐胜杰 |
地址: | 266109 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 溃疡 病菌 褐斑 丛枝病植 原体 多重 检测 核酸 试剂盒 方法 | ||
1.一组用于多重PCR同时检测三种病原菌的核酸,其特征在于,包括用于检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的上、下游引物,其中,所述溃疡病菌的上游引物序列如SEQID No.1所示,下游引物序列如SEQ ID No.2所示;
所述褐斑病菌的上游引物序列如SEQ ID No.5所示,下游引物序列如SEQ ID No.6所示;
所述丛枝病植原体的上游引物序列如SEQ ID No.9所示,下游引物序列如SEQ IDNo.10所示。
2.一组用于荧光定量PCR同时检测三种病原菌的核酸,其特征在于,包括如权利要求1中所述的用于检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的上、下游引物和各病原菌对应的探针,
所述溃疡病菌的探针序列如SEQ ID No.3所示;
所述褐斑病菌的探针序列如SEQ ID No.7所示;
所述丛枝病植原体的探针序列如SEQ ID No.11所示。
3.如权利要求1或2所述的核酸,其特征在于,该组核酸还包括检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的阳性扩增产物,其中,
所述检测溃疡病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.4中第29-194bp之间所示的序列;
所述检测褐斑病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.8中第20-213bp之间所示的序列;
所述检测丛枝病植原体的阳性扩增产物如SEQ ID No.12中第2-134bp之间所示的序列。
4.一种用于荧光定量PCR同时检测三种病原菌的试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括:如权利要求2中所述的用于检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的上、下游引物和相应的探针,各条探针的5'端和3'端分别对应标记FAM-BHQ1、JOE-TAMRA和CY5-BHQ3。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包括检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体的阳性扩增产物,其中,
所述检测溃疡病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.4中第29-194bp之间所示的序列;
所述检测褐斑病菌的阳性扩增产物如SEQ ID No.8中第20-213bp之间所示的序列;
所述检测丛枝病植原体的阳性扩增产物如SEQ ID No.12中第2-134bp之间所示的序列。
6.如权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,还包括Premix EX TaqTM×2。
7.一种用于荧光定量PCR同时检测三种病原菌的检测方法,其特征在于,该方法用于检测溃疡病菌、褐斑病菌和丛枝病植原体这三种病原菌,具体包括以下步骤:
(1)从样品中提取DNA;
(2)对提取的所述DNA进行荧光定量PCR扩增;其中,荧光定量PCR扩增时,在反应体系中,采用所述溃疡病菌的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示,其探针5'端和3'端分别对应标记FAM和BHQ1;所述褐斑病菌的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQ ID No.5、SEQ ID No.6和SEQ ID No.7所示,其探针5'端和3'端分别对应标记JOE和TAMRA;所述丛枝病植原体的上、下游引物和探针的核苷酸序列如SEQID No.9、SEQ ID No.10和SEQ ID No.11所示,其探针5'端和3'端分别对应标记CY5和BHQ3;
(3)收集荧光信号,选择步骤(2)中的荧光基团的荧光检测模式,基线调整取3~15个循环的荧光信号,以阈值线刚好超过正常阴性对照的最高点设定阈值线;
(4)结果判定:待测样品荧光增长曲线超过阈值线,并呈现良好的对数增长,则判断为阳性,如无典型的扩增曲线,判断为阴性。
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