[发明专利]血栓病易感基因联合检测试剂盒及其基因芯片检测法在审

专利信息
申请号: 201711042038.5 申请日: 2017-10-30
公开(公告)号: CN107557466A 公开(公告)日: 2018-01-09
发明(设计)人: 王放 申请(专利权)人: 吉林寰基生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883
代理公司: 昆明正原专利商标代理有限公司53100 代理人: 陈左
地址: 650217 云南省昆明市国家级*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 血栓病 基因 联合 检测 试剂盒 及其 基因芯片
【权利要求书】:

1.一种血栓病易感基因联合检测试剂盒,其特征在于,包括试剂盒Ⅰ和试剂盒Ⅱ,所述试剂盒Ⅰ由3管660μl/管PCR扩增试剂混合物、1管410μl/管PCR扩增引物混合物、1瓶4.2ml/瓶杂交缓冲液、1管125μl/管阴性参考品和1管125μl/管阳性参考品组成,所述PCR扩增试剂混合物由Hot Start Taq酶、UNG酶、dUTP、dNTP和缓冲系统组成,所述PCR扩增引物混合物由引物组成,所述杂交缓冲液由Tris-Hcl、TritonX-100、NaCl、甲酰胺和blocking组成,所述阴性参考品由纯化水组成,所述阳性参考品由质粒组成;所述试剂盒Ⅱ由2瓶45ml/瓶20×SSC、1瓶40ml/瓶10%SDS和1盒50测试/盒基因芯片组成。

2.根据权利要求1所述的血栓病易感基因联合检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒Ⅰ技术要求为:-18℃以下避光保存,有效期6个月;包装打开后,4℃储存,有效期1个月;所述试剂盒Ⅱ技术要求为:室温10-30℃下、避光保存,有效期6个月。

3.权利要求1所述的血栓病易感基因联合检测试剂盒的基因芯片检测法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)样本采集:采集口腔内上皮细胞标本,先用清水漱口,将棉拭子伸入口腔中,在口腔内侧脸颊粘膜处左右各刮拭10次,在刮拭的同时棉签要转动,将取样后的棉拭子放入无菌采样管中密封送检;

(2)芯片洗脱液配制:在芯片洗脱容器中按照蒸馏水或纯化水:20×SSC:10%SDS=100:5:1配制洗脱液Ⅰ,按照蒸馏水或纯化水:20×SSC:10%SDS=400:1:4配制洗脱液Ⅱ,洗脱液配制总体积应满足浸没芯片;

(3)样本处理:向采样管中加入1ml无菌生理氯化钠,充分震荡混匀,挤干棉拭子,将全部液体转移至无菌1.5ml离心管中,12,000rpm离心5min,弃上清,沉淀中加入无菌生理氯化钠1ml混匀,12,000rpm离心5min,弃上清,沉淀中加入100μl 核酸提取液,震荡混匀后100℃恒温处理10min,震荡混匀后12,000rpm离心5min,上清液即为临床样本DNA;取5μl参考品,加入50μl DNA提取液,震荡混匀后100℃恒温处理10min,震荡混匀后12,000rpm离心5min,上清液为参考品DNA;

(4)PCR扩增及标记:取临床样本DNA或参考品DNA 5μl、PCR扩增试剂混合物12.5μl、PCR扩增引物混合物7.5μl于0.2ml PCR薄壁管中进行扩增及标记;

(5)杂交:将恒温台或杂交箱开启升温恒定到42℃,用杂交模块将芯片固定好,预热10min,将PCR产物加热至95℃变性5min,PCR产物变性完毕取出后,立即冰浴3min,取75μl经42℃预热的杂交缓冲液和25μl临床样本扩增-标记产物充分混匀,将混合物全部滴加在芯片矩阵位置,将杂交模块水平放置42℃恒温箱或恒温台上杂交60min;

(6)洗脱:将芯片放入洗脱容器中,在37℃恒温水浴摇床100rpm震荡条件下进行洗脱;洗脱流程:洗脱液Ⅰ,1min;洗脱液Ⅱ,1min,洗脱完毕后,将芯片自然晾干或用低速离心机甩干即可进行扫描;

(7)扫描及结果判定:将干燥后的芯片置于激光扫描仪中使用532nm波长激光扫描,获得扫描数据及图谱,对检测数据进行分析,生成检测报告,HC为杂交对照点探针,NC为阴性参考点探针,IC为提取对照点探针,W表示该基因的正常基因型检测探针,M代表该基因的突变基因型检测探针,先判断对照NC,若其3个重复位点中,满足“阳性”的位点数≥2,则继续判断对照HC,若其3个重复位点中,满足“阳性”的位点数≥2,则继续进行判断对照IC,若其3个重复位点中,满足“阳性”的位点数≥2,则判读结果为“成功”,否则判读结果为“失败”;W /M探针荧光值≥2.0,判读为野生型,0.5<W /M探针荧光值<1.5,判读为杂合型,W /M探针探针荧光值≤0.5,判读为突变型。

4.根据权利要求3所述的血栓病易感基因联合检测试剂盒的基因芯片检测法,其特征在于,所述步骤(1)采集的待测样本采用冰壶或泡沫箱加冰袋密封运输,在2-8℃保存不应超过24小时,-18℃以下保存不超过三个月,-70℃以下长期保存。

5.根据权利要求3所述的血栓病易感基因联合检测试剂盒的基因芯片检测法,其特征在于,所述步骤(2)中若10%SDS出现白色絮状沉淀,于42℃条件加热至溶液透明后再使用,洗脱液一次配制可连续使用15天,每个试剂盒中提供的洗脱液在一个月内用完。

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