[发明专利]一种与鸡饲料利用效率性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了属于基因检测技术领域的一种与鸡饲料利用效率性状相关的分子标记及其应用。该SNP分子标记对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus‑5.0版本序列信息5号染色体正义链第9,226,493位，此处碱基为C或T。本发明的SNP分子标记与鸡饲料利用效率性状相关，是一个新的分子标记，通过确定待测鸡SNP位点的基因型对鸡饲料利用效率性状进行早期选择，能够节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于鸡的育种，具有很大的经济应用价值和科研价值。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种与鸡饲料利用效率性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

提高家禽的生产效率一直是家禽业的重要挑战之一。其中饲料转化率也称为饲料报酬是影响生产效率的重要一方面。就蛋鸡而言，饲料转化率(FCR)和剩余采食量效应(RFI)是评价蛋鸡生产效率的主要指标。而RFI与FCR相比是更加适用于评价蛋鸡饲料利用效率的批标，它被定义为实际采食量与预测采食量之间的差值。

采用传统育种方法对RFI的选择已经取得一定的进展，然而对蛋鸡而言，饲料效率的提升空间还很大。通过分子标记手段从遗传上可进一步提升蛋鸡饲料效率。与RFI相关的遗传变异可以用遗传标记进行关联，从而通过对标记的选择而改善RFI。全基因组关联分析是鉴定表型和基因型之间遗传联系的最主要手段之一。为鉴定表型和基因型之间的遗传联系，便于对饲料利用效率性状进行早期选择，节省生产成本并加快遗传进展，更好地服务于鸡的育种。因此，与鸡饲料利用效率性状相关的分子标记的研究具有重要意义。

发明内容

本发明为了准确地确定待测鸡的基因型以方便对饲料利用效率性状进行早期选择，节省生产成本并加快遗传进展，提出一种与鸡饲料利用效率性状相关的分子标记及其应用。具体技术方案如下：

一种与鸡饲料利用效率性状相关的SNP分子标记，所述SNP(单核苷酸多态性)分子标记对应于NCBI中公布的鸡参考基因组Gallus_gallus-5.0版本序列信息5号染色体正义链第9,226,493位，此处碱基为C或T(在NCBI网站上对应的rs号为rs14512566)。

所述的SNP分子标记在鸡遗传育种中的应用。

一种鸡饲料利用效率性状早期选择的方法，为根据上述SNP位点的基因型对鸡饲料利用效率性状进行早期选择，包括如下步骤：

(1)提取待测鸡的基因组DNA；

(2)检测待测鸡5号染色体正义链第9,226,493位SNP位点的基因型；

(3)基于SNP位点的基因型对鸡饲料利用效率性状进行早期选择，其中，TT基因型鸡饲料利用效率优于CT型和CC基因型，CT基因型鸡饲料利用效率优于CC基因型。

步骤(1)中所述提取待测鸡的基因组DNA的方法为：对待测鸡进行鸡翅静脉采血，用抗凝剂进行抗凝处理后经裂解、蛋白酶消化处理，然后采用酚仿法提取基因组DNA，以灭菌双蒸水溶解。

步骤(2)中基因型采用Axiom^TM Genome-Wide Chicken Genotyping Array检测。

步骤(2)中所述待测鸡5号染色体正义链第9,226,493位SNP分子标记的基因型为CC、CT或TT。

步骤(3)中所述鸡饲料利用效率为第37-40周龄的剩余采食量效应。

步骤(3)中所述TT基因型是指5号染色体正义链第9,226,493位碱基为T的纯合子；CC基因型是指该位点碱基为C的纯合子；CT基因型是指该位点碱基为C和T的杂合子。