[发明专利]一种鉴定柿属植物的方法

权利要求书

1.一种鉴别柿属植物方法，其特征在于，包括如下步骤：

（1）以待测柿属植物的基因组DNA为模板，用由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对其进行PCR扩增，得到PCR产物；

（2）将所述PCR产物测序后，所述PCR产物序列自5’端起的第53个核苷酸记为第1位，截掉所述PCR产物的核苷酸序列自5’末端起的前52个核苷酸以及含第749个以后的核苷酸，得到DUB序列；

（3）将所述DUB序列与DNA序列库中的全部序列放在一起进行比对，得到DNA比对序列矩阵；

所述DNA序列库为如下（a1）或（a2）：

（a1）由序列表中序列3至序列6中的至少一种组成；

（a2）由序列表中序列3至序列6中的至少一种，和序列7至序列14中的至少一种组成；

（4）根据所述DNA比对序列矩阵列出所述待测柿属植物的核苷酸分子式；

所述待测柿属植物的核苷酸分子式的通式为：

B₄B₉B₃₉B₄₂B₁₆₂B₁₈₆B₁₉₆B₂₀₁B₂₂₅B₂₂₇B₂₇₄B₂₉₉B₃₂₁B₃₄₀ B₃₄₄B₆₂₈；

在所述通式中，所述B₄、所述B₉、所述B₃₉、所述B₄₂、所述B₁₆₂、所述B₁₈₆、所述B₁₉₆、所述B₂₀₁、所述B₂₂₅、所述B₂₂₇、所述B₂₇₄、所述B₂₉₉、所述B₃₂₁、所述B₃₄₀、B₃₄₄和B₆₂₈，依次表示在DNA序列比对数据矩阵中的第4、9、39、42、162、186、196、201、225、227、274、299、321、340、344和628个位点，对应DUB序列的第4、9、39、42、162、186、196、201、225、227、274、299、321、340、344和628个核苷酸位点；

在所述通式中，每一个B为A、T、C和G中的任一种或两种；

（5）将步骤（4）所得所述待测柿属植物的核苷酸分子式与核苷酸分子式组I进行比对；

所述核苷酸分子式组I由如下a1）-a12）共12种核苷酸分子式组成：

a1）C₄T₉A₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉T₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a2）C₄C₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆A₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a3）C₄C₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆A₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉Y₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a4）C₄C₉G₃₉C₄₂R₁₆₂Y₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a5）T₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄A₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a6）C₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁C₂₂₅T₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a7）C₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆C₂₀₁C₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀T₃₄₄T₆₂₈；

a8）C₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆C₂₀₁C₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀Y₃₄₄T₆₂₈；

a9）C₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆C₂₀₁C₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a10）C₄T₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅T₂₂₇G₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a11）C₄T₉G₃₉Y₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅T₂₂₇G₂₇₄G₂₉₉C₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

a12）C₄Y₉G₃₉C₄₂A₁₆₂C₁₈₆G₁₉₆T₂₀₁G₂₂₅C₂₂₇C₂₇₄G₂₉₉T₃₂₁A₃₄₀C₃₄₄T₆₂₈；

在a1）-a12）中，Y表示T和C；R表示A和G；

（6）根据步骤（5）的比对结果，按照如下方法对所述待测柿属植物进行鉴定：

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a1）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为台湾乌木；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a2）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为乌柿x3号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a3）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为乌柿5号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a4）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为老鸦柿；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a5）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为金枣柿；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a6）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为浙江柿164号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a7）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为浙江柿873号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a8）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为君迁子4号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a9）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为君迁子8号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a10）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为美洲柿20-80号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a11）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为美洲柿20-82号；

若所述待测柿属植物的核苷酸分子式为a12）所示的核苷酸分子式，则所述待测柿属植物为或候选为油柿20-75号。