[发明专利]一种基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法在审
| 申请号: | 201710426009.2 | 申请日: | 2017-06-08 |
| 公开(公告)号: | CN107058586A | 公开(公告)日: | 2017-08-18 |
| 发明(设计)人: | 杨随娟;杨燕燕;刘虎 | 申请(专利权)人: | 上海龙鼎医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 200438 上海市杨浦区*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 定量 pcr 技术 gstm1 检测 方法 | ||
1.一种基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)采用二代测序验证的人GSTM1正常纯合子、杂合子和缺失纯合子基因组DNA作为相应对照物;
(2)采用GSTM1基因特异性的引物SEQ1和SEQ2扩增GSTM1基因片段,同时在GSTM1基因特异性的引物界定的扩增区域内设计GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam;若存在GSTM1基因,则GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam释放FAM荧光信号而被定量PCR仪器检到;若没有GSTM1片段,则无GSTM1扩增,无FAM荧光信号释放;
(3)采用ALbumin特异性的PCR引物SEQ4和SEQ5扩增ALbumin基因片段,同时在ALbumin基因特异性的引物界定的扩增区域内设计ALbumin基因特异性TAQman探针SEQ6-Vic;若存在合格样本,则有ALbumin扩增,释放Vic荧光信号,定量PCR仪器检测到Vic荧光信号;若样本不合格,则样本无ALbumin扩增,无Vic荧光信号释放;
(4)对比扩增FAM/VIC信号确认待检测样本基因型;
所述引物SEQ1的核苷酸序列号如下:5´-CCTGGCTGTCTAAACAGTCCT-3´;
所述引物SEQ2的核苷酸序列号如下:5´-CACTCACTGTGCCTGCTCAT-3´;
所述GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam的核苷酸序列号如下:
Fam-5´-TGCTGCCCATCCCTGCCCTCACAACCA-3´;
所述引物SEQ4的核苷酸序列号如下:5´-ACTCCAAACCTGATGCTTCT-3´;
所述引物SEQ5的核苷酸序列号如下:5´-CCTTAGGGCAGAATTATCCA-3´;
所述ALbumin基因特异性TAQman探针SEQ6-Vic的核苷酸序列号如下:
FAM-5´-CAGCCTGTTGCCCCTTTTAGAGTTCCTTTT-3´。
2.根据权利要求1所述的基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中人GSTM1正常纯合子、杂合子和缺失纯合子基因组DNA的浓度为10ng/μl。
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