[发明专利]一种基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法在审

专利信息
申请号: 201710426009.2 申请日: 2017-06-08
公开(公告)号: CN107058586A 公开(公告)日: 2017-08-18
发明(设计)人: 杨随娟;杨燕燕;刘虎 申请(专利权)人: 上海龙鼎医药科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 200438 上海市杨浦区*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 定量 pcr 技术 gstm1 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法,其特征在于,具体步骤如下:

(1)采用二代测序验证的人GSTM1正常纯合子、杂合子和缺失纯合子基因组DNA作为相应对照物;

(2)采用GSTM1基因特异性的引物SEQ1和SEQ2扩增GSTM1基因片段,同时在GSTM1基因特异性的引物界定的扩增区域内设计GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam;若存在GSTM1基因,则GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam释放FAM荧光信号而被定量PCR仪器检到;若没有GSTM1片段,则无GSTM1扩增,无FAM荧光信号释放;

(3)采用ALbumin特异性的PCR引物SEQ4和SEQ5扩增ALbumin基因片段,同时在ALbumin基因特异性的引物界定的扩增区域内设计ALbumin基因特异性TAQman探针SEQ6-Vic;若存在合格样本,则有ALbumin扩增,释放Vic荧光信号,定量PCR仪器检测到Vic荧光信号;若样本不合格,则样本无ALbumin扩增,无Vic荧光信号释放;

(4)对比扩增FAM/VIC信号确认待检测样本基因型;

所述引物SEQ1的核苷酸序列号如下:5´-CCTGGCTGTCTAAACAGTCCT-3´;

所述引物SEQ2的核苷酸序列号如下:5´-CACTCACTGTGCCTGCTCAT-3´;

所述GSTM1基因特异性TAQman探针SEQ3-Fam的核苷酸序列号如下:

Fam-5´-TGCTGCCCATCCCTGCCCTCACAACCA-3´;

所述引物SEQ4的核苷酸序列号如下:5´-ACTCCAAACCTGATGCTTCT-3´;

所述引物SEQ5的核苷酸序列号如下:5´-CCTTAGGGCAGAATTATCCA-3´;

所述ALbumin基因特异性TAQman探针SEQ6-Vic的核苷酸序列号如下:

FAM-5´-CAGCCTGTTGCCCCTTTTAGAGTTCCTTTT-3´。

2.根据权利要求1所述的基于定量PCR技术的GSTM1分型检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中人GSTM1正常纯合子、杂合子和缺失纯合子基因组DNA的浓度为10ng/μl。

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