[发明专利]一种山羊CSN1S1基因插入/缺失的检测方法及其应用

权利要求书

1.一种山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性作为提高山羊第一胎产羔数性状的分子标记，包括以下步骤：

以待测山羊全基因组DNA为模板，以引物对P1为引物，PCR扩增山羊CSN1S1基因部分片段；再对PCR扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊CSN1S1基因上的插入/缺失多态性；

所述引物对P1为：

上游引物：5’- GCTGGAAGCAGTTCGTCA -3’；

下游引物：5’- GGGTTGATAGCCTTGTATGTT -3’；

所述山羊CSN1S1基因上的插入/缺失多态性的琼脂糖凝胶电泳结果为：插入/插入基因型表现为170 bp的一条带纹；插入/缺失基因型表现为170 bp和159 bp以及异源双链条带共三条带纹；缺失/缺失基因型表现为159 bp的一条带纹。

2.根据权利要求1所述一种山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述山羊CSN1S1基因上的插入/缺失多态性是指NC_030813.1: g.6654-6664位11-bp插入/缺失多态性。

3.根据权利要求1所述一种山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述PCR 扩增的反应程序为：95 ℃预变性5 min；94 ℃变性 30 s，60.5 ℃复性30 s，72 ℃延伸25 s，35个循环；72℃延伸10 min。

4.根据权利要求1所述一种山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述的琼脂糖凝胶电泳是质量浓度3.0% 的琼脂糖凝胶电泳。

5.一种用于检测山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性作为提高山羊第一胎产羔数性状的分子标记的试剂盒，其特征在于：包括用于PCR扩增山羊CSN1S1基因上11-bp插入/缺失多态位点的引物对P1，所述的引物对P1为：

上游引物：5’- GCTGGAAGCAGTTCGTCA -3’；

下游引物：5’- GGGTTGATAGCCTTGTATGTT -3’。

6.一种如权利要求1所述的山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性的检测方法在以山羊CSN1S1基因插入/缺失多态性作为提高山羊第一胎产羔数性状的分子标记的山羊分子标记辅助选择育种中应用。

7.山羊CSN1S1基因存在的11-bp插入/缺失多态性位点：NC_030813.1: g.6654-6664在山羊分子标记辅助选择育种中的应用，其特征在于：所述插入/缺失多态性位点的插入/插入基因型作为提高山羊第一胎产羔数性状的分子标记。

8.根据权利要求6、7中任意一项所述的应用，其特征在于：所述山羊选自陕北白绒山羊。