[发明专利]一步法快速构建扩增子文库的方法有效
| 申请号: | 201710218529.4 | 申请日: | 2017-04-05 |
| 公开(公告)号: | CN106835292B | 公开(公告)日: | 2019-04-09 |
| 发明(设计)人: | 阎海;王思振;焦宇辰;徐大勇;郑乔松;师晓 | 申请(专利权)人: | 北京泛生子基因科技有限公司 |
| 主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京中誉威圣知识产权代理有限公司 11279 | 代理人: | 田昕;叶立涛 |
| 地址: | 102206 北京市昌平区回龙观镇中关*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一步法 快速 构建 扩增 文库 方法 | ||
1.一种用于构建DNA样品的扩增子文库的方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)合成用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合,所述用于构建DNA样品的扩增子文库的引物组合包括:
根据目标扩增子设计的上游融合引物,所述上游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第一接头序列(Bridge序列)和根据目标扩增子设计的特异性上游引物序列;
根据目标扩增子设计的下游融合引物,所述下游融合引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第二接头序列(trP1序列)和根据目标扩增子设计的特异性下游引物序列;
上游通用引物,所述上游通用引物包括按照5’到3’的方向依次排列的第三接头序列(A序列)、barcode序列和第一接头序列;和
下游通用引物,所述下游通用引物包括按照5’到3’的方向依次排列的通用序列(Uni序列)和第二接头序列;
2)构建DNA样品的PCR反应体系,将根据目标扩增子设计的上游融合引物、根据目标扩增子设计的下游融合引物、上游通用引物和下游通用引物混合以作为PCR反应体系中的引物组合;
3)进行PCR;
所述第一接头序列包括SEQ ID:1序列;所述第二接头序列包括SEQ ID:2序列;所述第三接头序列包括SEQ ID:3序列;所述通用序列包括SEQ ID:4序列;
用于构建同一个DNA样品的扩增子文库的引物组合中,上游通用引物中的barcode序列相同;用于构建不同DNA样品的扩增子文库的引物组合中,上游通用引物中的barcode序列不同。
2.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的方法,其特征在于:当同一个PCR反应中的目标扩增子的数量>1时,所述根据目标扩增子设计的上游融合引物为根据每一种目标扩增子设计的上游融合引物的组合,所述根据目标扩增子设计的下游融合引物为根据每一种目标扩增子设计的下游融合引物的组合。
3.如权利要求1所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的方法,其特征在于:所述DNA样品为基因组DNA。
4.如权利要求3所述的用于构建DNA样品的扩增子文库的方法,其特征在于:基因组DNA提取自组织样本或福尔马林固定石蜡包埋样本。
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