[发明专利]松材线虫SSR标记引物用于松材线虫检测的用途及松材线虫的PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 201710170203.9 申请日: 2017-03-21
公开(公告)号: CN106755554A 公开(公告)日: 2017-05-31
发明(设计)人: 韩珊;王方方;朱天辉;刘应高;谯天敏;李姝江;刘裕峰;张博阳;李鸿朋;黄焱焱;阮若玉;余鹏举;何俊尧 申请(专利权)人: 四川农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙)51241 代理人: 周佳
地址: 611130 四川省*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 松材线虫 ssr 标记 引物 用于 检测 用途 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种松材线虫SSR标记引物用于松材线虫检测的用途,所述SSR标记引物为:

上游引物:5’-TTATCGGGCTCAATCTCGG-3’

下游引物:5’-TAGTGACCCGGGGATCTTC-3’。

2.一种检测松材线虫的PCR方法,包括以下步骤:

1)提取松材线虫基因组DNA;

2)使用TaqDNA聚合酶对步骤1)所得DNA进行扩增,PCR反应体系组成为:Taq PCR Master Mix 12.5μL,上、下游引物各0.5μL,模板DNA量为50ng,ddH2O补充至25μL;其中,所述上、下游引物为权利要求1所述的引物,上、下游引物量均为10μM;

扩增程序为:94℃预变性3min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,共34个循环;72℃延伸5min;

3)对步骤2)所得扩增产物做电泳检测,通过电泳结果是否含有一条314bp的条带,从而检测、鉴定或鉴别是否含有松材线虫。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤3)所述电泳检测为1.2%琼脂糖凝胶电泳。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,还包括以下步骤4):

4)将步骤3)所得314bp条带回收纯化,测序,通过判断测序结果是否与序列表SEQ ID NO.1所示的SSR标记基因序列相同,进一步确认松材线虫的检测、鉴定或鉴别结果。

5.一种用于检测松材线虫的试剂盒或检测系统,包括权利要求1所述的引物。

6.根据权利要求5所述的试剂盒或检测系统,其特征在于,所述试剂盒或检测体统还包括PCR扩增试剂、电泳试剂和/或序列分析软件。

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