[发明专利]CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元、包含该功能单元的载体及其应用有效

专利信息
申请号: 201710146782.3 申请日: 2017-03-13
公开(公告)号: CN107012164B 公开(公告)日: 2023-03-03
发明(设计)人: 张勇;唐旭;郑雪莲;邓科君;周建平 申请(专利权)人: 电子科技大学
主分类号: C12N15/82 分类号: C12N15/82
代理公司: 成都虹桥专利事务所(普通合伙) 51124 代理人: 梁鑫
地址: 611731 四川省成*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: crispr cpf1 植物 基因组 定向 修饰 功能 单元 包含 载体 及其 应用
【权利要求书】:

1.CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:包括Cpf1核酸酶蛋白表达单元和crRNA转录表达克隆单元两个结构区域;所述的Cpf1核酸酶蛋白表达单元从5’到3’方向依次为:启动子-Cpf1核酸酶编码基因-终止子;所述的crRNA转录表达克隆单元从5’到3’方向依次为:启动子-核酶A编码序列-crRNA克隆单元的编码序列-核酶B编码序列-终止子;所述的启动子为Pol II型启动子;

所述的功能单元从5’到3’方向依次为:

pZmUbi1-LbCpf1 ORF-Nos T-pZmUbi1-HH Ribozyme-crRNA cloning scaffold-HDVRibozyme-Nos T;

其中,所述pZmUbi1即玉米Ubi1启动子,LbCpf1 ORF即毛螺科菌Cpf1核酸酶蛋白编码框,Nos T即Nos终止子,HH RiboZyme即HH核酶,crRNA cloning scaffold即向导crRNA克隆单元的编码序列,HDV RiboZyme即HDV核酶。

2.如权利要求1所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:所述Cpf1核酸酶编码基因的5’端和/或3’端融合核定位信号NLS编码序列。

3.如权利要求2所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:所述的NLS为SV40 NLS、nucleoplasmin NLS、c-Myc NLS、TUS-protein NLS或EGL-13 NLS中的至少一种。

4.如权利要求3所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:

所述的LbCpf1核酸酶蛋白编码框5’端融合SV40 NLS序列,5’端SV40 NLS的氨基酸序列如Seq ID No.2所示;LbCpf1核酸酶蛋白编码框3’端融合nucleoplasmin NLS序列,3’端NLS的氨基酸序列如Seq ID No.3所示。

5.如权利要求4所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:包含核定位信号的LbCpf1核酸酶蛋白的氨基酸序列如Seq ID No.1所示的。

6.如权利要求5所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:编码包含核定位信号的LbCpf1核酸酶蛋白的核苷酸序列如Seq ID No.6中 2049~5831位所示。

7.如权利要求1所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:crRNA转录表达克隆单元的编码序列中连有BsaⅠ-ccdB-BsaⅠ序列。

8.如权利要求7所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:BsaⅠ-ccdB-BsaⅠ序列的苷酸序列如Seq ID No.6中 8231~8867位所示。

9.如权利要求1所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:所述的核酶A编码序列- crRNA克隆单元的编码序列-核酶B编码序列的核苷酸序列如Seq IDNo.6中 8166~8936位所示。

10.如权利要求1~9任一项所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元,其特征在于:所述的pZmUbi1-LbCpf1 ORF-Nos T-pZmUbi1-HH Ribozyme-crRNA cloningscaffold-HDV Ribozyme-Nos T功能单元的核苷酸序列如Seq ID No.6所示。

11.含有权利要求1~10任一项所述的CRISPR/Cpf1植物基因组定向修饰功能单元的载体。

12.如权利要求11所述的载体,其特征在于:所述的载体为植物转基因骨架载体。

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