[发明专利]微生物的检查方法、微生物的检查试剂盒、微生物检查用微阵列、霉菌检测用载体、霉菌的检测方法、以及霉菌检测用试剂盒

权利要求书

1.一种微生物的检查方法，其特征在于，

从植物组织或土壤、水、或其他的环境中采集试样、从所述试样中所含的微生物组中提取DNA、使用提取出的DNA进行PCR、基于所得的扩增产物来判定所述试样中的微生物的有无，

所述检查方法使用以根肿菌属菌的DNA中的β-微管蛋白基因作为利用PCR的扩增的标靶的由正向引物和反向引物组成的第一引物组、和所述提取出的DNA进行PCR，基于所得的扩增产物，来判定所述试样中的根肿菌属菌的有无，所述正向引物包含序列编号1～3所示的碱基序列的至少任意一个，所述反向引物包含序列编号4、5所示的碱基序列的至少任意一个。

2.根据权利要求1所述的微生物的检查方法，其特征在于，

使第一扩增产物与固定化有第一探针的微阵列接触，所述第一探针与使用根肿菌属菌的DNA和所述第一引物组利用PCR得到的所述第一扩增产物互补地结合，且包含序列编号12所示的碱基序列及其互补序列的至少任意一个，

检测与所述第一探针互补地结合了的所述第一扩增产物的标记。

3.根据权利要求1或2所述的微生物的检查方法，其特征在于，

以根肿菌属菌、腐霉属菌、以及疫霉属菌的DNA中的β-微管蛋白基因作为利用PCR的扩增的标靶，基于使用所述第一引物组和所述提取出的DNA进行PCR所得的扩增产物，同时地判定所述试样中的根肿菌属菌、腐霉属菌、以及疫霉属菌的有无。

4.根据权利要求3所述的微生物的检查方法，其特征在于，

使第二扩增产物与固定化有第二探针的微阵列接触，所述第二探针与使用腐霉属菌的DNA和所述第一引物组利用PCR得到的所述第二扩增产物互补地结合，且包含序列编号13或14所示的碱基序列及它们的互补序列的至少任意一个，

检测与所述第二探针互补地结合了的所述第二扩增产物的标记。

5.根据权利要求3或4所述的微生物的检查方法，其特征在于，

使第三扩增产物与固定化有第三探针的微阵列接触，所述第三探针与使用疫霉属菌的DNA和所述第一引物组利用PCR得到的所述第三扩增产物互补地结合，包含序列编号15或16所示的碱基序列的至少任意一个，

检测与所述第三探针互补地结合了的所述第三扩增产物的标记。

6.根据权利要求3～5中任一项所述的微生物的检查方法，其特征在于，

使第四扩增产物与固定化有第四探针的微阵列接触，所述第四探针与使用根肿菌属菌、腐霉属菌、疫霉属菌、以及其他的微生物的至少任意一种的DNA和所述第一引物组利用PCR得到的第四扩增产物互补地结合，且包含序列编号17所示的碱基序列及其互补序列的至少任意一个，

检测与所述第四探针互补地结合了的所述第四扩增产物的标记。

7.根据权利要求1～6中任一项所述的微生物的检查方法，其特征在于，

基于使用以根肿菌属菌的DNA中的rDNA基因ITS区作为利用PCR的扩增的标靶的由正向引物和反向引物组成的第二引物组、和所述提取出的DNA进行PCR所得的扩增产物，来判定所述试样中的根肿菌属菌的有无，所述正向引物包含序列编号6所示的碱基序列，所述反向引物包含序列编号9所示的碱基序列。

8.根据权利要求7所述的微生物的检查方法，其特征在于，

使第五扩增产物与固定化有第五探针的微阵列接触，所述第五探针与使用根肿菌属菌的DNA和所述第二引物组利用PCR得到的所述第五扩增产物互补地结合，且包含序列编号18所示的碱基序列及其互补序列的至少任意一个，

检测与所述第五探针互补地结合了的所述第五扩增产物的标记。

9.根据权利要求1～8中任一项所述的微生物的检查方法，其特征在于，

基于使用以腐霉属菌的DNA中的rDNA基因ITS区作为利用PCR的扩增的标靶的由正向引物和反向引物组成的第三引物组、和所述提取出的DNA进行PCR所得的扩增产物，来判定所述试样中的腐霉属菌的有无，所述正向引物包含序列编号7或8所示的碱基序列的至少任意一个，所述反向引物包含序列编号10所示的碱基序列。