[发明专利]转基因玉米BT176核酸标准样品及其制备方法在审
| 申请号: | 201610163923.8 | 申请日: | 2016-03-22 |
| 公开(公告)号: | CN105695595A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
| 发明(设计)人: | 曹际娟;郑秋月;刘冉;于珂 | 申请(专利权)人: | 曹际娟;郑秋月;刘冉;于珂 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/63;C12N15/10 |
| 代理公司: | 大连博晟专利代理事务所(特殊普通合伙) 21236 | 代理人: | 于忠晶 |
| 地址: | 116000 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 转基因 玉米 bt176 核酸 标准 样品 及其 制备 方法 | ||
1.一种转基因玉米BT176核酸标准样品,其特征在于:所述转基因玉米BT176核酸标准 样品包含转基因玉米BT176品系特异性基因片段和玉米内源zein基因片段,具体序列为:
转基因玉米BT176品系特异性基因片段序列:
ggccgtgaacgagctgttnnnnnnnagcaaccagatcggccgacaccnnnnnnnnnntta
gaaaacatgtaggcttcttccc;
玉米内源zein基因片段序列:
cgtcgtttcccatctcttcctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatcagggctcattttc
tcgctcctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactg
agggtctcggagtgg。
2.根据权利要求1所述的一种转基因玉米BT176核酸标准样品,其特征在于:所述转基因 玉米BT176品系特异性基因片段为玉米基因组DNA与BT176品系特异基因之间的边界序列。
3.一种根据权利要求1所述的转基因玉米BT176核酸标准样品的制备方法,其特征在 于:包括以下步骤:
第一步:总DNA提取:
取转基因玉米BT176品系种子进行种植,并在玉米成熟后收取转基因玉米作为原料,采 用TaKaRa公司的DNA提取试剂盒(货号D9093)进行DNA提取;
第二步:特异性PCR扩增:
特异性PCR扩增的25μL反应体系:10×PCRBuffer2μL,dNTPs(2.5mmol/L)2μL,Ex Taq(5U/μL)0.2μL,引物(10pmol/μL)各1μL,模板DNA(0.3-6μg/μL)2μL,用无菌水补充至25 μL;
异性PCR扩增的反应条件:94℃预变性3.0min;94℃变性0.4min,55℃退火1min,72℃延 伸1min,35个循环;72℃5min;4℃保存,引物及探针序列见表1:
表1引物及探针序列
;
第三步:PCR扩增产物回收纯化:
PCR扩增产物回收纯化采用PCR纯化试剂盒(DV805A)(TaKaRaAgaroseGelDNA PurificationKitVer.2.0试剂盒(DV805A))进行;
第四步:质粒制备:
将PCR扩增后获得的转基因玉米BT176品系特异性基因、玉米内源zein基因的目的片段 回收后,连接至pMD19-TVector载体,通过筛选鉴定获得具有插入片段的克隆,质粒标准样 品再经其他有资质的测序公司进行测序比对确认,具体步骤如下:
(1)选取载体与连接
选取宝生物工程(大连)有限公司生产的pMD19-TVector载体,将T载体与插入目标基 因片段大小按如下比例连接:
连接体系为:
高效连接液(LigationMix宝生物工程(大连)有限公司)2μL
插入基因片段(Insertfragment)2μL
T载体1μL
蒸馏水15μL
4℃,连接过夜;
(2)制备JM109感受态细胞
挑一个感受态细胞的单菌落到10mL不含有抗生素的LB培养基中,37℃剧烈振摇培养 3h,使其浓度达到OD600=0.4左右,将培养好的感受态细胞分装在1.5mL经高压灭菌的EP管 中,冰浴10min,之后4℃,4100rpm离心10min,弃净培养基,用750mL预冷的0.1mol/LCaCl2溶液重悬细胞,4℃,4100rpm离心10min,弃净CaCl2溶液,200μL预冷的0.1mol/LCaCl2重悬 细胞,4℃存放一周内使用,或加入10%灭菌甘油,-70℃存放待用;
(3)热转化
将(1)中的连接液20μL加入至100μLJM109感受态细胞中,放置冰中30min;42℃加热 45s后,再在冰中放置2-5min;加入900μLSOC培养基,转入15mL小管中,37℃振荡培养60 min;以100μL和200μL两个梯度涂SOC平板,37℃过夜培养,形成单菌落,计数白色、蓝色菌 落;
(4)阳性克隆的筛选
用灭菌牙签挑取白色菌落,进行PCR筛选,电泳确定插入片段大小,挑选已经插入正确 片段的菌落植菌,4mLTB(Amp)培养,37℃过夜;
(5)质粒回收
应用质粒回收纯化试剂盒(TaKaRaMiniBESTPlasmidPurificationKitVer.2.0 (货号DV801A))回收质粒DNA,挑选阳性克隆质粒DNA进行DNA双向测序,确保构建的质粒DNA 与预期DNA序列一致;
(6)目标分子DNA线性化处理
将上述质粒,即目标分子DNA用Hind-Ⅲ限制酶进行线性化处理,经PCl3抽提、乙醇精制, 取1μL进行电泳确认,即得转基因玉米BT176核酸标准样品。
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