[发明专利]刺参ITGB基因、编码蛋白及其克隆方法和重组刺参ITGB基因工程菌构建方法有效

专利信息
申请号: 201610118991.2 申请日: 2016-03-02
公开(公告)号: CN105713907B 公开(公告)日: 2019-05-28
发明(设计)人: 李成华;王振辉;张卫卫;邵铱娜;李晔;吕志猛 申请(专利权)人: 宁波大学
主分类号: C12N15/12 分类号: C12N15/12;C12N15/10;C07K14/705;C12N15/70
代理公司: 宁波奥圣专利代理事务所(普通合伙) 33226 代理人: 何仲
地址: 315211 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 刺参 itgb 基因 编码 蛋白 及其 克隆 方法 重组 基因工程 构建
【权利要求书】:

1.一种刺参ITGB基因,其特征在于该基因为SEQIDNO.1所示的cDNA序列。

2.一种权利要求1所述的刺参ITGB基因的克隆方法,其特征在于:根据与ITGB基因同源的表达序列标签EST序列设计基因特异性引物,采用RACE技术扩增基因全长,具体的步骤如下:

(1)通过对灿烂弧菌诱导刺参血细胞cDNA文库的表达序列标签分析,发现了多条编码ITGB基因的表达序列标签序列,选取编码刺参ITGB部分片段的表达序列标签克隆;

(2)RACE引物设计:根据编码刺参ITGB部分片段的表达序列标签克隆设计RACE的巢式引物:3’上游特异性引物1:GGTTCATTGTCAAATCGGAG,3’上游特异性引物2:GATTACGTCGCTCTGGTCCA,5’下游特异性引物1:CCAACAATTCTGCAACCTCCG,

5’下游特异性引物2:TGCAACAAGGGGCACTTGGAG,扩增3’接头引物Adaptor3:TACCGTCGTTCCACTAGTGATTT,扩增5’接头引物Adaptor5:CATGGCTACATGCTGACAGCCTA;

(3)RACE扩增获取ITGB基因全长序列,具体步骤如下:

a.总RNA提取:取刺参体腔液制备得到RNA提取液;

b.3’-RACE扩增:将RNA提取液用3’-Full RACE Core Set with PrimeScriptTMRTase试剂盒逆转录合成扩增3’的模板,以此为模板,使用3’上游特异性引物1和扩增3’接头引物进行PCR扩增,取PCR稀释后的产物1ul作为模板,再用3’上游特异性引物2和扩增3’接头引物进行PCR扩增得到3’端目的条带;

c.5’-RACE扩增:将上述RNA提取液用5’-Full RACE Kit试剂盒逆转录合成扩增5’的模板,具体合成方法依试剂盒说明书操作,以此为模板,使用5’下游特异性引物1和Adaptor5进行PCR扩增,取PCR产物稀释后1ul作为模板,再用5’下游特异性引物2和Adaptor5进行PCR得到5’端目的条带;

d.将上述扩增产物的目的条带用胶回收试剂盒回收,回收产物与载体pMD18-T连接,转化至大肠杆菌Escherichia coli DH5α后,在含有氨苄浓度为50μg/mL的LB平板培养基中培养8-12h,挑取阳性克隆菌落,进行RCR验证并送至上海生物工程有限公司测序,所得结果经DNAMAN软件分析拼接得刺参ITGB基因全长序列,其基因序列如SEQIDNO.1所示,其中LB平板培养基配方为胰蛋白胨10g/L、酵母提取物5g/L、NaCl 10g/L。

3.根据权利要求2所述的一种刺参ITGB基因的克隆方法,其特征在于RACE扩增反应体系:模板1.0μL,10×PCR缓冲液2.5μL,浓度25mM的MgCl2 2.0μL,浓度10mM的dNTP 2.0μL,浓度10μM的特异性引物1.0μL,浓度10μM的接头引物1.0μL,浓度5U/μL的DNA聚合酶0.2μL,超纯水:15.3μL;扩增条件:94℃3min、94℃30s、60℃30s、72℃1min,共35个循环,最后72℃延伸10min。

4.一种权利要求1所述的刺参ITGB基因的编码蛋白,其特征在于:该编码蛋白为SEQIDNO.2所示的氨基酸序列。

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