[发明专利]基于代谢物及基因表达筛选三七皂苷合成关键基因的方法在审
| 申请号: | 201610114420.1 | 申请日: | 2016-03-01 |
| 公开(公告)号: | CN105671159A | 公开(公告)日: | 2016-06-15 |
| 发明(设计)人: | 齐炼文;陆续;王宁;李萍 | 申请(专利权)人: | 中国药科大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N30/02 |
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| 地址: | 211198 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 代谢物 基因 表达 筛选 三七 皂苷 合成 关键 方法 | ||
1.一种基于代谢物及基因表达筛选三七皂苷合成关键基因的方法,其特征在于包括如 下步骤:
(1)分析三七不同部位三萜皂苷类物质代谢轮廓;
(2)分析皂苷合成途径关键基因在三七不同部位的表达谱;
(3)构建基因表达和皂苷的代谢相关图,筛选出三七中皂苷合成关键基因。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述代谢轮廓采用高效液相色谱-质谱联 用系统进行,所述表达谱采用荧光定量PCR进行,所述相关图采用典型关联分析进行。
3.根据权利要求1所述的方法,所述不同部位包括:叶、叶柄及根。
4.根据权利要求1所述的方法,所述关键基因包括:法尼基焦磷酸合酶(FPS)、鲨烯合酶 (SQS)、鲨烯环氧酶(SE)、达玛烷二醇合成酶(DS)、细胞色素P450氧化酶(CYP716A53)。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征还在于采用高效液相色谱-质谱联用系统对三七 样品的甲醇提取物进行分析。
6.根据权利要求2所述的方法,所述定量分析具体是分别提取样品RNA,再将RNA反转录 合成第一链cDNA,以cDNA为模板,进行实时荧光定量PCR。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤(3)中所述的基因表达量和皂苷代谢量 的相关关系网络图的构建,是通过典型关联分析将三七皂苷含量与皂苷合成途径关键基因 表达量相结合而分析得到的,具体是使用皮尔逊相关系数对皂苷含量及皂苷合成途径关键 基因表达量进行典型相关分析,变量相关系数高于0.5作为筛选关键合成基因的标准。
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