[发明专利]建立克服基因功能冗余的全基因组功能缺失筛选方法

权利要求书

1.一种构建靶向基因家族的组合siRNA文库的方法，其特征在于，所述方法包括步骤：

(1)提供一蛋白组群；

(2)根据所述蛋白组群中的各蛋白序列信息，进行基于结构域的多序列比对，把具有相同结构域的蛋白归为一类，形成蛋白超家族；

(3)对所述蛋白超家族中蛋白种类＞n的蛋白超家族进行拆分获得蛋白家族；对所述蛋白超家族中蛋白种类≤n的蛋白超家族不进行拆分，直接归类为蛋白家族；从而实现各蛋白家族中家族成员数均≤n；

(4)提供针对各蛋白家族中各成员的siRNA，将针对同一蛋白家族中各成员的siRNA组成siRNA集，针对不同蛋白家族的siRNA集构成了所述靶向基因家族的组合siRNA文库；

其中n为2、3、4、或5。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，n为2、或3。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括≥200种蛋白。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括≥500种蛋白。

5.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括≥1000种蛋白。

6.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括≥2000种蛋白。

7.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括≥5000种蛋白。

8.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述蛋白组群包括同一物种的70％～100％的蛋白种类。

9.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(1)中，所述蛋白组群中的各蛋白均具有对应的天然或非天然siRNA。

10.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(2)中，对于包含多个结构域的蛋白，经基于结构域的多序列比对后，根据比对结果的统计显著性，留取统计显著性最小的结构域，把具有相同的所述统计显著性最小的结构域的蛋白归类到一起，形成所述蛋白超家族。

11.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述步骤(3)中，对所述蛋白超家族中蛋白种类＞n的蛋白超家族进行拆分获得蛋白家族的具体步骤包括：

(a)对蛋白质超家族中的各个蛋白进行多重序列比对；

(b)根据步骤(a)的比对结果构建系统发育树；

(c)基于所述系统发育树反应出的序列远近关系，将系统树拆分为蛋白家族，每个蛋白家族的成员数≤n。