[发明专利]用于检测胃癌相关代谢小分子的液质联用模型及制备方法在审
| 申请号: | 201610053053.9 | 申请日: | 2016-01-26 |
| 公开(公告)号: | CN105699514A | 公开(公告)日: | 2016-06-22 |
| 发明(设计)人: | 崔大祥;成尚利 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
| 主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/06 |
| 代理公司: | 上海旭诚知识产权代理有限公司 31220 | 代理人: | 郑立 |
| 地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 胃癌 相关 代谢 分子 联用 模型 制备 方法 | ||
1.一种用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液质联用模型,其特征在于利 用高效液相色谱-质谱联用仪测定胃癌患者和健康人唾液样本的代谢小分子,并筛 选出相应的胃癌相关代谢小分子标志物,其中所述的胃癌相关代谢小分子标志物包 括:脯氨酸、β-氨基异丁酸、谷氨酸、羟脯氨酸、谷氨酰胺、γ-氨基丁酸、 鹅肌肽和肌肽。
2.如权利要求1所述的用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液质联用模 型,其特征在于,高效液相色谱条件为:选用C18色谱柱,流动相A为0.01% 七氟丁酸与0.1%甲酸水溶液;流动相B为0.01%七氟丁酸与0.1%甲酸乙腈溶 液,进行梯度洗脱,均为体积百分比;流速为0.8mL/min,柱温为50℃。
3.如权利要求2所述的用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液质联用模 型,其特征在于,所述梯度洗脱的条件为:0min(98%流动相A+2%流动相B), 9.5min(76%流动相A+24%流动相B),11.0min(20%流动相A+80%流动相B), 16.0min(98%流动相A+2%流动相B),25.0min(98%流动相A+2%流动相B), 均为体积百分比。
4.如权利要求1~3任一项所述的用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液 质联用模型,其特征在于,质谱条件为:电喷雾离子源,正离子扫描,MRM扫 描方式,气帘气为137.9kPa,碰撞气为中等,喷雾气为413.7kPa,辅助加热气 为413.7kPa,电压为1500V,去簇电压为30V,人口电压为10V,碰撞能为30V, 出口电压为5V。
5.一种如权利要求1~4任一项所述的用于检测胃癌相关代谢小分子标志物 的液质联用模型的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一、收集多例胃癌患者唾液样本和健康人的唾液样本分别作为病例组 和对照组,进行低温冷冻备用;
步骤二、对所述唾液样本进行解冻,加入aTRAQTMKitPhysiological衍生 化试剂进行预处理;
步骤三、对预处理过的两组唾液样本进行高效液相色谱-质谱检测,并收集 检测到的代谢小分子的检测数据;
步骤四、对于高效液相色谱-质谱检测到的代谢小分子,用Mann-WhitneyU test方法进行差异性检验,得到16种在病例组和对照组中存在明显差异的代谢 小分子;
步骤五、对所述存在明显差异的代谢小分子使用百分比差异度进行评估, 得到百分比差异度得分最大的代谢小分子脯氨酸;
步骤六、以对照组唾液样本中脯氨酸浓度的均值作为聚类分割值,将全部 样本分为2个子类,脯氨酸浓度小于所述聚类分割值的归为一个子类命名为 M1,脯氨酸浓度大于等于所述聚类分割值的归为另一个子类命名为M2,并通 过ROC曲线比较聚类前后的曲线线下面积;
步骤七、使用mRMR的方法,分别对所述M1子类和所述M2子类中的代 谢小分子进行打分,根据打分值进行排序,得到小分子与胃癌相关度的顺序; 按照小分子与胃癌相关度的顺序,从相关度大的开始,先选择1个小分子,利 用最近邻方法进行胃癌判断和“刀切法”得到胃癌判断的准确率;选择n个小 分子,利用最近邻方法再次进行胃癌判断和“刀切法”得到新的准确率,直到 选择所有的16个小分子为止;当准确率最大时,得到建模需要的小分子数目 及其胃癌判断的准确率;其中,n<=16;结果是得到了羟脯氨酸、谷氨酰胺、 γ-氨基丁酸、鹅肌肽、肌肽、β-氨基异丁酸、谷氨酸和脯氨酸,作为胃癌相 关代谢小分子标志物,建立用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液质联用模 型。
6.如权利要求5所述的用于检测胃癌相关代谢小分子标志物的液质联用模 型的制备方法,其特征在于,所述步骤一中收集到的唾液样本经离心去上皮细 胞后以上清液作为唾液待测样本进行低温冻存备用。
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