[发明专利]一种预测细胞表型不稳定性的方法

权利要求书

1.一种预测细胞系表型稳定的方法，包括步骤：

在测定期培养细胞系；

在测定期的多个不同时间点产生细胞系的环境响应指纹，其中每个环境响应指纹通过在至少三种不同的化学细胞应激源中的每种存在时测定细胞的环境响应产生；以及

比较多个环境响应指纹以检测在测定期环境响应指纹的改变，其中在测定期环境响应指纹的改变程度指示细胞系中预测的表型不稳定性的程度。

2.根据权利要求1所述的方法，其中比较多个环境响应指纹以检测在测定期环境响应指纹的改变的步骤包括：在所述至少三种不同的化学细胞应激源中的每种的环境响应指纹中检测改变的步骤。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述环境响应是生长响应、产量响应或糖基化响应。

4.根据权利要求1所述的方法，其中所述多个不同时间点跨越测定期的一代或多代。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述环境响应指纹在测定期内的三个或更多个时间点产生。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述环境响应指纹在测定期内的四个或更多个时间点产生。

7.根据权利要求1所述的方法，其中每个所述环境响应指纹通过在至少三种不同的化学细胞应激源中的每种存在时测定细胞的环境响应产生。

8.根据权利要求1所述的方法，其中每个环境响应指纹通过在至少五种不同的化学细胞应激源中的每种存在时测定细胞的环境响应产生。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述化学细胞应激源选自氨基酸转运抑制剂、细胞周期抑制剂、碳源、渗透压应激源、氧化应激源、细胞凋亡引发剂、代谢效应物、pH调节剂、醣酵解抑制剂，以及毒素。

10.根据权利要求1所述的方法，其中所述细胞系是哺乳动物的生产细胞系。

11.根据权利要求1所述的方法，其中测定期环境响应指纹的改变通过选自欧几里得距离、马哈拉诺比斯距离、LDA距离、PCA距离的方法来确定。

12.根据权利要求1所述的方法，其中至少三种不同的化学细胞应激源中的每种的浓度设置为0.5到2倍IC50。

13.一种鉴定细胞的系统，该系统包括：

包括多个反应室的装置；

单独设置在该反应室内的至少三种不同的化学细胞应激源；

在三种不同的化学细胞应激源中的每种存在时测定细胞环境响应的测定系统；

存储多个环境响应指纹的存储系统，每个环境响应指纹对应细胞的多个环境响应；

配置用于比较多个环境响应指纹中的至少一些以检测环境响应指纹改变的比较系统；以及

显示比较步骤输出的显示系统。

14.根据权利要求13所述的系统，其中所述环境响应指纹是生长响应指纹、产量响应指纹或糖基化响应指纹。

15.根据权利要求13所述的系统，其中所述装置是微量滴定板。

16.根据权利要求13所述的系统，其中所述比较系统包括计算模型，配置用于输入在测定期的多个不同时间点的细胞环境响应指纹的计算模型，比较生长响应指纹、产量响应指纹或糖基化响应指纹以检测指纹的改变，以及输出部分基于指纹的改变的内容。