[发明专利]与黄瓜短果把紧密连锁的两个SNP标记及其应用

权利要求书

1.两个与黄瓜短果把基因紧密连锁的SNP标记，其特征在于，是Chr4SNP-fs01和Chr4SNP-fs02，其中Chr4SNP-fs01位于黄瓜基因组第4号染色体15,735,913处，Chr4SNP-fs01处碱基为A的黄瓜为短果把，为G的黄瓜为长果把；Chr4SNP-fs02位于黄瓜基因组第4号染色体16,650,897处；

Chr4SNP-fs02处碱基为G的黄瓜为短果把，为A的黄瓜为长果把。

2.Chr4SNP-fs01和Chr4SNP-fs02作为与黄瓜短果把基因紧密连锁的SNP标记的应用，其中Chr4SNP-fs01位于黄瓜基因组第4号染色体15,735,913处，Chr4SNP-fs01处碱基为A的黄瓜为短果把，为G的黄瓜为长果把；Chr4SNP-fs02位于黄瓜基因组第4号染色体16,650,897处；Chr4SNP-fs02处碱基为G的黄瓜为短果把，为A的黄瓜为长果把。

3.一组用于用于检测权利要求1所述与黄瓜短果把基因相关的SNP标记的引物对，其特征在于：包括Chr4SNP-fs01的引物对：

上游引物5′-GGGCATGTATCTCTCTACCATGATT-3′，

反向引物5′-TCCCAAAAGCAAGACAAG-3′；

Chr4SNP-fs02的引物对：

正向引物5′-ACAAGTCAGTCGATCAAA-3′，

反向引物5′-TTTGCAAGCAAACATTTTTCTCTTT-3′。

4.权利要求1所述的SNP及衍生的dCAPS引物在黄瓜短果把分子标记辅助育种中的应用。

5.如权利要求4所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

1)提取待检测黄瓜基因组DNA；

2)以待检测黄瓜基因组DNA为模板，利用权利要求3所述引物对，进行PCR扩增反应；

3)使用HindⅢ限制性内切酶酶切Chr4SNP-fs01引物对所扩增的PCR产物，使用MseI限制性内切酶酶切Chr4fs-pm02引物对所扩增的PCR产物酶切；

4)经上述酶酶切后电泳，若条带没有被HindⅢ和MseI酶切，则为长果把品系；若条带被HindⅢ和MseI酶切则为短果把品系。