[发明专利]大豆黄色相关基因分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种大豆黄色相关基因分子标记及其应用。本发明提供了大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸的单核苷酸多态性在鉴定大豆黄色突变体中的应用；所述单核苷酸多态性是指所述大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G或A。本发明提供的功能标记可以准确用于本发明所示的大豆黄色突变体与野生型组配后代真伪性鉴定及其它相关研究工作。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种大豆黄色相关基因分子标记开发及其应用。

背景技术

叶色变异是比较常见的突变性状，一般在苗期表达，但少数突变体直到生育后期才发生叶色突变。由于突变基因往往是直接或间接影响叶绿素的合成和降解，改变叶绿素含量，所以叶色突变体也称为叶绿素突变体。叶色变异通常影响突变体光合效率，造成作物减产，严重时甚至导致植株死亡，因此过去常被认为是无意义的突变。近年来，叶色突变体的利用价值受到越来越多关注。在育种工作中，叶色变异可作为标记性状，简化良种繁育和杂交种生产；植株可为作物遗传育种提供优良种质资源。

在基础研究中，颜色改变是研究植物光合作用、光形态建成、激素生理以及抗病机制等一系列生理代谢过程的理想材料；同时颜色突变体可用于分析鉴定基因功能，了解基因互作。因而，研究大豆黄化突变体不仅有理论意义，同时还有重要的实际应用价值。

发明内容

本发明的目的是提供一种大豆黄色相关基因分子标记的开发及其应用。

本发明所提供的应用具体为大豆基因组中Glyma13g30560基因(Glycine maxWm82.a1.v1，下同)第1727位核苷酸的单核苷酸多态性在鉴定大豆黄色突变体中的应用；所述单核苷酸多态性是指所述大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G或A。

当然，用于鉴定大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G还是A的物质在鉴定大豆黄色突变体的应用也属于本发明的保护范围。

在所述应用中，所述用于鉴定大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G还是A的物质包括且不限于本发明的引物对；所述引物对中的上游引物根据所述大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸的上游序列进行设计，所述引物对中的下游引物根据所述大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸的下游序列进行设计。

所述用于鉴定大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G还是A的物质除了包括且不限于本发明的引物对外，还包括与所述引物对相互配合使用的限制性内切酶以及其它检测方法。

在本发明中，所述用于鉴定大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G还是A的物质为如下(a)或(b)或(c)：

(a)引物对A；

(b)所述引物对A和引物对B；

(c)所述引物对A、所述引物对B和限制性内切酶MboII；

所述引物对A为由序列表中序列4所示的单链DNA和序列5所示的单链DNA组成的引物对；所述引物对B为由序列表中序列6所示的单链DNA和序列7所示的单链DNA组成的引物对。

本发明还提供了用于鉴定大豆黄化突变体和/或鉴定待测大豆基因组中Glyma13g30560基因的第1727位核苷酸为G还是A的引物对、成套引物以及试剂盒。

本发明所提供的用于鉴定大豆黄色突变体的引物对，具体为序列表中序列4和序列5所示单链DNA组成的引物对。

在实际应用中，所述引物对中的两条单链DNA在PCR反应体系中的摩尔比可为1：1。