[发明专利]一种用于检测大肠杆菌的引物及其方法和应用有效
| 申请号: | 201510236760.7 | 申请日: | 2015-05-11 |
| 公开(公告)号: | CN104862394B | 公开(公告)日: | 2019-02-12 |
| 发明(设计)人: | 毛小琴;刘有福;宋玉竹;牛华;夏雪山 | 申请(专利权)人: | 昆明理工大学 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/10;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 谈杰 |
| 地址: | 650500 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 检测 大肠杆菌 引物 及其 方法 应用 | ||
本发明公开了一种用于检测大肠杆菌的引物及其方法和应用,所述的引物核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示,针对所涉及的引物,建立了大肠杆菌的检测方法,其具有特异性良好、灵敏较好、检测快速可靠、操作简单的特点,同时设计包含该引物的试剂盒,便于大肠杆菌的检测。本发明针对大肠杆菌的特异基因LafF设计特异引物,该引物可以快速、简便、准确的检测大肠杆菌。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种用于检测大肠杆菌的引物及其应用。
背景技术
大肠埃希氏菌(Escherichia coli)习惯称为大肠杆菌,分类于肠杆菌科,归属于埃希氏菌属。大部分大肠杆菌是人及各种动物肠道中的正常寄居菌,食物或水中大肠杆菌的检出意味着直接或间接的近期粪便污染。大肠杆菌作为饮水、食品等的粪源性污染卫生细菌学指标;而且其在外界存活时间与一些主要肠道病原菌相近。它的出现也可能预示某些肠道病原菌(如沙门氏菌、志贺氏菌)的存在。大肠杆菌是国际上公认的卫生监测指示菌,因此大肠杆菌的检测技术显得十分重要。
传统的大肠杆菌的检测方法有常规涂片镜检法、培养法等,但是这些方法存在一定的缺陷,如常规涂片镜检是最基本的细菌学检查方法,但是敏感性低,特异性差;培养法是目前临床上发现传染源的主要途径和手段,但一般需4到7天的时间,操作繁琐,费时耗力,不能实现快速的目的。
本发明利用生物信息学寻找出大肠杆菌特异基因,并针对其设计引物,建立了大肠杆菌的检测方法,实现了简便、快速、准确的检测出大肠杆菌的目的。
发明内容
本发明针对现有技术的缺陷,提出了一种用于检测大肠杆菌的基因,通过生物信息学手段获取该可用于鉴定大肠杆菌的特异基因,并针对该基因涉及引物。
本发明的另一目的在于针对所涉及的引物,建立了大肠杆菌的检测方法,其具有特异性良好、灵敏较好、检测快速可靠、操作简单的特点。
本发明的第三个目的在于提供一种检测大肠杆菌的试剂盒,便于大肠杆菌的检测。
本发明具体通过以下技术方案实现:
一种用于检测大肠杆菌的引物,包括上游引物和下游引物,所述的上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述的下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
通过实验证明,本发明提供的检测引物对大肠杆菌具有良好的特异性,该检测引物针对的靶基因片段LafF基因。
一种检测大肠杆菌的方法,包括以下步骤:
1)提取待检测样品的模板DNA;
2)设计上述所述的引物;
3)PCR扩增:
反应体系:Taq 0.125μL,10×聚合酶缓冲液2.5μL,dNTP 2μL,Mg2+1.6μL,模板1μL,上下游引物各1μL,加ddH2O补足25μL;
反应条件:95℃5min;95℃30s,57℃30s,72℃20s,30个循环;72℃1min;
4)利用琼脂糖凝胶电泳方法判断检测结果。
一种用于检测大肠杆菌的试剂盒,包括引物SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2,具体为:10×聚合酶缓冲液2.5μL,dNTP 2μL,Mg2+1.6μL,模板1μL,上下游引物各1μL,ddH2O 25μL。
本发明的有益效果为:针对大肠杆菌的特异基因LafF设计特异引物,该引物可以快速、简便、准确的检测大肠杆菌。
附图说明
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