[发明专利]一种人运动神经元基因拷贝数相对定量检测方法及试剂盒有效

专利信息
申请号: 201510066921.2 申请日: 2015-02-09
公开(公告)号: CN104630368B 公开(公告)日: 2017-04-12
发明(设计)人: 赵书民;赵翊均;周巍;陈林;龚虎涛 申请(专利权)人: 上海五色石医学研究有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 上海正旦专利代理有限公司31200 代理人: 陆飞,盛志范
地址: 201203 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 运动 神经元 基因 拷贝 相对 定量 检测 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种人运动神经元拷贝数相对定量检测方法,其特征在于:是采用四个PCR反应分别对SMN1基因第7和第8外显子、SMN2基因第7和第8外显子进行拷贝数相对定量检测,并采用第五PCR反应对SMN1第6和第3外显子上三个热点突变进行定性检测,其中:

(1)第一PCR反应,是针对SMN1基因第7外显子的相对定量检测PCR反应;采用如下引物与探针:

公用上游引物P1、公用引物P2、RPP40上游引物P3、RPP40下游引物P4、RPP40检测探针P5、SMN1第7外显子上游引物PE7-1F、SMN1第7外显子下游引物PE7-1R、SMN1第7外显子检测探针PE7-1D、SMN2第7外显子封闭探针PE7-2A;

(2)第二PCR反应,是针对SMN1基因第8外显子的相对定量检测PCR反应,采用如下引物与探针:

公用上游引物P1、公用引物P2、RPP40上游引物P3、RPP40下游引物P4、RPP40检测探针P5、SMN1第8外显子上游引物PE8-1F、SMN1第8外显子下游引物PE8-1R、SMN1第8外显子检测探针PE8-1D、SMN2第8外显子封闭探针PE8-2A;

(3)第三PCR反应,是针对SMN2基因第7外显子的相对定量检测PCR反应;采用如下引物与探针:

公用上游引物P1、公用引物P2、RPP40上游引物P3、RPP40下游引物P4、RPP40检测探针P5、SMN2第7外显子上游引物PE7-2F、SMN2第7外显子下游引物PE7-2R、SMN2第7外显子检测探针PE7-2D、SMN1第7外显子封闭探针PE7-1A;

(4)第四PCR反应,是针对SMN2基因第8外显子的相对定量检测PCR反应;采用如下引物与探针:

公用上游引物P1、公用引物P2、RPP40上游引物P3、RPP40下游引物P4、RPP40检测探针P5、SMN2第8外显子上游引物PE8-2F、SMN2第8外显子下游引物PE8-2R、SMN2第8外显子检测探针PE8-2D、SMN1第8外显子封闭探针PE8-1A;

(5)第五PCR反应,是针对SMN1第6外显子和第3外显子3个热点突变检测的反应,采用如下引物与探针:

公用上游引物P1、公用引物P2、RPP40上游引物P3、RPP40下游引物P4、RPP40检测探针P5、SMN1第6外显子Y272C上游引物P272-F、SMN1第6外显子11bp-DUP上游引物P11-F、SMN1第6外显子下游引物PE6-R、SMN1第6外显子Y272C检测探针P272-D、SMN1第6外显子Y272C竞争探针P272-A、SMN1第6外显子11bp-DUP检测探针P11-D、SMN1第3外显子4bp-DEL上游引物PE3-4F、SMN1第3外显子4bp-DEL下游引物PE3-4R、SMN1第3外显子4bp-DEL检测探针PE3-4D;

其中,引物与探针所对应的核苷酸序列与修饰特征如下表

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