[发明专利]生物标志物鉴定

权利要求书

1.用于鉴定生物标志物的设备，所述设备包括电子处理装置，所述电子处理装置：

a)使用来自多个个体的参考数据以定义个体的许多组，所述参考数据包括多个参考生 物标志物的活性的测量值；

b)使用多个分析技术以鉴定来自多个参考生物标志物的潜在地可用于区分个体的组 的许多潜在的生物标志物，允许所述潜在的生物标志物被用于生成用于在临床评估中使用 的标记物。

2.根据权利要求1所述的设备，其中，对于每个分析技术，所述电子处理装置：

a)使用所述分析技术，鉴定最佳区分个体的组的许多参考生物标志物；

b)确定所鉴定的参考生物标志物的预测性能是否超过预定的阈值；以及，

c)响应于成功的确定，确定所鉴定的参考生物标志物是潜在的生物标志物。

3.根据权利要求2所述的设备，其中所述参考生物标志物的数目是以下的至少一个：

a)少于10个；

b)多于1个；

c)在2和8之间；以及，

d)5个。

4.根据权利要求2或权利要求3所述的设备，其中所述预定的阈值是以下的至少一个：

a)至少90％；

b)至少85％；以及，

c)至少80％。

5.根据权利要求1至4的任一项所述的设备，其中所述电子处理装置：

a)将潜在的生物标志物添加至潜在的生物标志物集合；以及，

b)从参考生物标志物集合去除所述潜在的生物标志物。

6.根据权利要求1至5的任一项所述的设备，其中对于多个分析技术的每个，所述电子 处理装置重复地鉴定参考生物标志物为潜在的生物标志物，直到所鉴定的参考生物标志物 的预测性能降到低于所述预定的阈值。

7.根据权利要求1至6的任一项所述的设备，其中所述电子处理装置迭代地鉴定潜在的 生物标志物。

8.根据权利要求1至7的任一项所述的设备，其中所述电子处理装置使用包括以下的至 少一个的许多迭代：

a)至少100次；

b)至少500次；

c)至少1000次；

d)至少2000次；以及，

e)至少5000次。

9.根据权利要求1至8的任一项所述的设备，其中所述电子处理装置重复地确定潜在的 生物标志物直到潜在的预定数目的生物标志物被鉴定。

10.根据权利要求9所述的设备，其中所述潜在的生物标志物的所述预定数目包括以下 的至少一个：

a)至少100个；

b)少于500个；

c)约200个。

11.根据权利要求1至10的任一项所述的设备，其中所述分析技术包括以下的至少一 个：

a)回归技术；

b)相关性分析；以及，

c)回归技术和相关性技术的组合。

12.根据权利要求1至12的任一项所述的设备，其中所述分析技术包括：

a)稀疏的PLS；

b)随机森林；以及，

c)支持向量机。

13.根据权利要求1至12的任一项所述的设备，其中所述电子处理装置：

a)在确定所述潜在的生物标志物之前从所述参考数据去除验证子组；

b)使用无所述验证子组的所述参考数据确定所述潜在的生物标志物；以及，

c)使用所述验证子组来验证以下的至少一个：

i)所述潜在的生物标志物；以及，

ii)包括许多所述潜在的生物标志物的标记物。