[发明专利]用于非入侵性性染色体非整倍性确定的统计分析

权利要求书

1.一种用于计算母体样品中胎儿X或Y染色体非整倍性的风险的系统，所述系统包括用于执行下列步骤的装置：

体外询问一个或更多个Y染色体基因座；

体外询问一个或更多个X染色体基因座；

体外询问至少第一常染色体上一个或更多个多态性基因座；

其中所述系统还包括计算机系统，所述计算机系统包括：

用于通过分析所述第一常染色体上多态性的频率来计算所述母体样品中的胎儿核酸比例的装置；

用于估计所述母体样品中胎儿Y染色体、胎儿X染色体和胎儿第一常染色体的相对胎儿染色体频率的装置；

用于通过使用所计算的胎儿核酸比例来计算所述母体样品中所述胎儿Y染色体以无拷贝、一个拷贝、或两个或更多个拷贝存在的似然值的装置；

用于通过比较所计算的似然值与假定无拷贝的所述胎儿Y染色体的第一数学模型、假定一个拷贝的所述胎儿Y染色体的第二数学模型和假定两个或更多个拷贝的所述胎儿Y染色体的第三数学模型来计算所述母体样品中所述胎儿Y染色体的非整倍性的风险的装置；

用于通过使用所计算的胎儿核酸比例来计算所述母体样品中所述胎儿X染色体以一个拷贝、两个拷贝、或三个或更多个拷贝存在的似然值的装置；以及

用于通过比较所计算的似然值与假定一个拷贝的所述胎儿X染色体的第一数学模型、假定两个拷贝的所述胎儿X染色体的第二数学模型和假定三个或更多个拷贝的所述胎儿X染色体的第三数学模型来计算所述母体样品中所述胎儿X染色体的非整倍性的风险的装置。

2.如权利要求1所述的系统，其中至少96个多态性基因座被测量以计算所述胎儿核酸比例。

3.如权利要求1或2所述的系统，所述系统还包括用于确定所述母体样品中的所述胎儿核酸比例是否足以可靠地执行分析的装置。

4.如权利要求1所述的系统，其中至少十个或更多个多态性基因座被询问。

5.如权利要求4所述的系统，其中至少两个常染色体上的至少十个或更多个多态性基因座被询问。

6.如权利要求5所述的系统，其中通过分析来自至少两个常染色体的多态性的频率来计算所述母体样品中的胎儿核酸比例。

7.如权利要求5所述的系统，其中至少三个常染色体上的至少十个或更多个多态性基因座被询问。

8.如权利要求7所述的系统，其中通过分析来自至少三个常染色体的多态性的频率来计算所述母体样品中的所述胎儿核酸比例。

9.如权利要求1所述的系统，其中所述X染色体、所述Y染色体和所述第一常染色体的每一个上至少24个基因座被询问。

10.如权利要求9所述的系统，其中所述X染色体、所述Y染色体和所述第一常染色体的每一个上至少32个基因座被询问。

11.如权利要求10所述的系统，其中每一个基因座被测量至少100次。

12.如权利要求1-2和4-11中任一项所述的系统，其中使用关于现有风险的外来信息调整胎儿非整倍性的计算的风险。

13.如权利要求3所述的系统，其中使用关于现有风险的外来信息调整胎儿非整倍性的计算的风险。

14.如权利要求1所述的系统，其中利用X染色体胎儿频率计算胎儿X染色体非整倍性的风险。

15.如权利要求1所述的系统，其中利用Y染色体胎儿频率计算胎儿Y染色体非整倍性的风险。