[发明专利]检测K-ras基因突变的探针、引物、试剂盒及方法在审
| 申请号: | 201410790009.7 | 申请日: | 2014-12-17 |
| 公开(公告)号: | CN104694622A | 公开(公告)日: | 2015-06-10 |
| 发明(设计)人: | 李兆申;高军;金晶;李泉江;唐旖旎;朱艳萍;丁佳寅;诸娴;王玉琼 | 申请(专利权)人: | 上海长海医院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海序伦律师事务所 31276 | 代理人: | 周东萍 |
| 地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 ras 基因突变 探针 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测K-ras基因突变的探针,其特征在于,所述探针是与K-ras基因第13位密码子的突变型序列特异性结合的Taqman MGB荧光探针,所述K-ras基因第13位密码子的突变型选自:AGC、CGC、TGC、GAC、GCC、GTC。
2.根据权利要求1所述的探针,其特征在于,所述探针包括SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示序列的探针。
3.根据权利要求2所述的探针,其特征在于,所述SEQ ID NO:2探针上标记的荧光与SEQ ID NO:3探针上标记的荧光不同。
4.一种检测K-ras基因突变的引物,其特征在于,所述引物用于扩增包含K-ras基因第13位密码子的核苷酸序列,该引物包括SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示序列的引物对。
5.一种检测K-ras基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
与K-ras基因第13位密码子的突变型序列特异性结合的Taqman MGB荧光探针,所述K-ras基因第13位密码子的突变型选自:AGC、CGC、TGC、GAC、GCC、GTC;
用于扩增包含K-ras基因第13位密码子的核苷酸序列的引物对;
针对野生型K-ras基因第13位密码子GGC设计的PNA。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示序列的探针;
SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5所示序列的引物对;
SEQ ID NO:1所示序列的PNA。
7.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:K-ras基因第13位密码子的野生型和突变型标准品。
8.一种检测K-ras基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
针对野生型的K-ras基因第13位密码子GGC设计PNA;
针对K-ras基因第13位密码子的AGC、CGC、TGC、GAC、GCC、GTC六种突变型设计TaqmanMGB荧光探针,并设计一对引物,该引物用于扩增包含K-ras基因第13位密码子的核苷酸序列;
利用所述PNA、Taqman MGB荧光探针、以及引物,对已知突变量的质粒标准品进行实时定量PCR检测,根据检测结果制出标准曲线;
对待测样本DNA进行实时定量PCR检测,根据标准曲线,以及Taqman MGB探针荧光的类别,判别K-ras基因第13位密码子的突变量和突变类型。
9.根据权利要求8所述的检测K-ras基因突变的方法,其特征在于,所述PNA如SEQ ID NO:1所示,所述Taqman MGB荧光探针包括SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示序列的探针,所述引物包括SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示序列的引物对。
10.权利要求5所述检测K-ras基因突变的试剂盒在制备诊断肿瘤的产品中的应用。
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