[发明专利]猪产仔数性状的遗传标记及应用

说明书

技术领域

本发明属于家畜分子标记(遗传标记)制备技术领域，具体涉及一种猪产仔数性状的遗传标记及应用。所述的遗传标记克隆自猪STIM1基因。

背景技术

猪的产仔数是繁殖性状中重要的经济性状，直接关系到养猪业的经济收益，提高猪产仔数对提高养猪业的总体经济效益意义重大。据统计，在我国如果母猪产仔数每胎提高1头，每年将增收190亿人民币的纯利(王莉兴和鲁绍雄，2008)。母猪产仔数性状是一个由排卵、受精、着床、胎儿发育等多个具有时间顺序特征的组分性状构成的复合性状，属于遗传力很低(0.1左右)的数量性状，难以用常规育种技术进行遗传改良，所以寻找控制猪繁殖率的主效基因及其遗传标记对提高猪产仔数具有重要意义。

STIM1(Stromal interaction molecule 1)基因参与调节胞内Ca²⁺浓度，在哺乳动物卵母细胞中表达，可能参与调节卵母细胞成熟和受精过程。STIM1蛋白能感受内质网内钙库Ca²⁺浓度，从而调节Ca²⁺内流，参与形成Ca²⁺释放激活Ca²⁺通道(CRAC)，引发钙库控制的Ca²⁺内流(SOCE)，调控膜内外的Ca²⁺浓度，与钙振荡相关(Strange et al.,2007；陈晓芳等，2009；高尚邦和李臣鸿，2009)。而卵母细胞的减数分裂激活和成熟，以及受精过程均受到钙振荡的调节(李妍等，2007；Ajduk et al.,2008)。2009年，Koh等首次报道STIM1存在于哺乳动物卵母细胞中，并且在猪卵母细胞中STIM1能探测内质网Ca²⁺浓度，并触发SOCE(Koh et al.,2009)。2012年最新研究表明，STIM1在鼠成熟卵母细胞中的表达量远高于未成熟卵母细胞，且仅在成熟卵母细胞中才能检测到SOCE(Gómez-Fernández et al.,2012)。小鼠中，精子刺激后，STIM1在小鼠卵母细胞中迅速迁移，并参与受精过程钙振荡的维持(Gómez-Fernández et al.,2009)。在秀丽新小杆线虫中发现，STIM1干扰后导致生殖腺形态异常，无法正常排卵，也无法受精(Yan et al.,2006)，STIM1是秀丽新小杆线虫正常排卵和繁殖力所必须的(Lorin-Nebel et al.,2007)。另外，大量研究报道STIM1对肿瘤有抑制作用，如子宫颈癌(Chen et al.,2011)、乳腺癌(McAndrew et al.,2011)、卵巢癌(Ritchie et al.,2011)等。

综上所述，STIM1基因与动物繁殖性能有着密切联系，参与调控卵母细胞成熟及受精过程。目前猪STIM1基因对母猪产仔数的影响还未见报道。因此，申请人克隆了猪STIM1部分基因序列，利用该序列进行了多态性和关联分析等研究，以期获得与猪产仔数相关的新分子标记。

发明内容

本发明的目的在于扩增猪STIMQ基因的DNA序列，以寻找该基因序列突变位点多态性，获得一种与猪产仔数性状相关的遗传标记，并利用该遗传标记作为猪标记辅助选择。

本发明通过以下技术方案实现：

本发明获得了一种猪产仔数性状的遗传标记，它是猪DTIM1基因的部分DNA片段，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1(长度为691bp)和SEQ ID NO：2(长度为690bp)所示。在SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2第256bp处存在一个T碱基的插入/缺失突变(如图3所示)，该位点位于猪STIM1基因第10内含子与第11外显子交界处。

申请人提供了一种扩增猪STIM1基因部分DNA片段的引物对，该引物对的DNA序列如SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示。

申请人提供了一种筛选猪产仔数性状相关基因STIM1遗传标记的方法，其步骤如下：