[发明专利]一种筛选微藻积脂调控酶的方法有效
| 申请号: | 201410581886.3 | 申请日: | 2014-10-27 |
| 公开(公告)号: | CN104374812A | 公开(公告)日: | 2015-02-25 |
| 发明(设计)人: | 李玉芹;穆锦秀;陈迪;韩方欣;徐华;刘婷婷;刘飞 | 申请(专利权)人: | 湘潭大学 |
| 主分类号: | G01N27/26 | 分类号: | G01N27/26;G01N27/62 |
| 代理公司: | 湘潭市汇智专利事务所(普通合伙) 43108 | 代理人: | 颜昌伟 |
| 地址: | 411105 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 筛选 微藻积脂 调控 方法 | ||
1.一种筛选微藻积脂调控酶的方法,包括如下步骤:(1)建立实验室人工模拟下的盐环境,培养盐敏感小球藻及耐盐小球藻;(2)藻细胞全蛋白的荧光差异凝胶电泳蛋白组学分析;(3)藻细胞积脂关键调控酶的甄选与鉴定。
2.根据权利要求1所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述实验室人工模拟的盐环境具体为:向基础培养基中加入NaCl,使氯化钠的质量分数达到3.5%,经灭菌、冷却后,按培养基体积的1-10%接入藻细胞种子液,然后在28℃条件下培养12-72小时。
3.根据权利要求1所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述的盐敏感小球藻为普通淡水小球藻,所述的耐盐小球藻为海水小球藻。
4.根据权利要求1所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述的基础培养基具体为:按质量份数计,Glucose10份、KH2PO41.25份、Urea3份、MgSO4·7H2O1份、Na2EDTA0.5份、H3BO30.12份、CaCl20.84份、ZnSO4·7H2O0.88份、MnCl2·4H2O0.014份、Na2ΜoO40.007份、CuSO4·5H2O0.016份、Co(NO3)2·6H2O0.005份、FeSO4·7H2O0.05份、蒸馏水1000份,培养基pH6.1,115℃灭菌20min。
5.根据权利要求1所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述的藻细胞全蛋白的荧光差异凝胶电泳蛋白组学分析具体为:(a)藻细胞全蛋白提取、纯化与定量:离心收集藻细胞团进行裂解、超声处理,然后破碎核酸,离心收集上清液蛋白,经纯化、过夜沉淀、自然干燥后获得纯蛋白质团块,团块重溶后以紫外分光光度法测定其浓度;(b)蛋白质荧光差异凝胶二维电泳分析:蛋白样品经pH调试、染色、一维等电聚焦、二维双向SDS-PAGE(聚丙烯酰氨凝胶电泳)后,获得蛋白凝胶片;(c)凝胶图谱差异蛋白点分析:蛋白凝胶片经扫描成像,然后采用计算机图谱数字分析化法分析2D凝胶图谱包括蛋白质点的检测、背景消除和点的匹配、蛋白点匹配和体积计算,筛选重复性高、差异表达2.5倍以上的蛋白质点或者新诱导、消失的有意义蛋白点;(d)差异蛋白质谱鉴定:差异蛋白经切胶、胶内酶解、点靶上机、质谱分析获得肽质量指纹图谱,再进行数据库检索:利用软件flex Analysis过滤基线峰、识别信号峰,再利用MASCOT程序和搜索引擎实施NCBInr、SWISS-PROT及TrEMBL蛋白数据库检索,寻找匹配蛋白,查询其功能,明确蛋白身份。
6.根据权利要求5所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述的数据库检索条件为:1)肽质量范围:800-4000Da;2)表观pI与表观Mr的误差范围:无限制;3)一级质谱质量误差范围:50ppm;4)二级质谱质量误差范围:0.6Da;5)酶解片段不完全即遗漏酶切位点:1个;6)物种来源:Chlorella vulgaris;7)电荷:+1;8)同位素峰:monoisotopic;9)固定修饰:半胱氨酸碘乙酰胺化;10)可变修饰:蛋氨酸氧化。
7.根据权利要求1所述的筛选微藻积脂调控酶的方法,所述的藻细胞积脂关键调控酶的甄选与鉴定具体为:
将差异蛋白质转换成相应的NCBI-gi登录号即不同组别差异蛋白登录号,输入http://www.pir.georgetown.edu/pirwww/search/batch.shtml网站,按照相关操作,采用GO富集分析差异表达蛋白质的亚细胞位置包括细胞质、细胞核和细胞膜的定位及生物学功能;
采用Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes即KEGG数据库分析差异蛋白在生物体内所参与的生物通道,确保每个生物通路中至少含有3个差异蛋白。登录网站http://www.genome.jp,选择物种Chlorella vulgaris,选择物种登录号种类NCBI-gi,进行具体通路分析;若KEGG数据库网站没有Chlorella vulgaris,则选择该网站与之相近物种数据,将Chlorella vulgaris差异蛋白登录号匹配成与之相近物种蛋白登录号,以%identity和%positives两种参数衡量匹配度,选择匹配相识度高大于80%的匹配登录号进行差异表达蛋白的KEGG代谢通路分析,从而甄选与鉴定出油脂合成关键调控酶。
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