[发明专利]肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒、使用方法及应用有效
| 申请号: | 201410240322.3 | 申请日: | 2014-05-30 |
| 公开(公告)号: | CN104152542A | 公开(公告)日: | 2014-11-19 |
| 发明(设计)人: | 祁小飞 | 申请(专利权)人: | 苏州大学附属第一医院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 曹毅 |
| 地址: | 215000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 肿瘤 abl1 基因 位点分型 检测 试剂盒 使用方法 应用 | ||
1.肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,该检测试剂盒包括:PCR试剂和LDR试剂,所述的PCR试剂包括一对PCR正向引物和反向引物、双蒸水、聚合酶、聚合酶配套缓冲液、dNTP和MgCl2;
所述正向引物如SEQ ID NO.2所示:5’-CACCATGGAGGTGGAAGAGT-3’;
所述反向引物如SEQ ID NO.3所示:5’-TCTGAGTGGCCATGTACAGC-3’。
2.根据权利要求1所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述LDR试剂包括相关位点的荧光探针、检测探针、双蒸水、Taq连接酶和连接酶配套缓冲液;所述聚合酶为Taq酶。
3.根据权利要求2所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述LDR所用荧光探针序列为:
5’-P-TGAGTTCATGACCTACGGGAACCTCTACCTACCTACCTACC-FAM-3’;所述LDR所用检测探针序列为:如SEQ ID NO.5所示5’-ACCTACCTACCTACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCAC-3’和如SEQ ID NO.6所示5’-CTACCTACCTACCTACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCAT-3’,所述连接产物长度分别为82和84。
4.根据权利要求1所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述荧光标记的一部分为和模板配对部分,另一部分则可引入随机系列来调整LDR产物长度,所述荧光探针在3’进行荧光标记和5’端进行磷酸化标记;所述荧光探针的荧光基团为5-FAM、6-FAM、TAMRA、HEX、TET、JOE、VIC、NED、ROX、D1、D2、D3或D4。
5.根据权利要求2所述的ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述检测探针的一部分为和模板配对部分,另一部分则可引入随机系列来调整LDR产物长度,所述检测探针根据突变位点的需要进行设计,检测探针为2-4根探针,检测探针中的3’端为检测位点。
6.肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒的使用方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA,以待测样品基因组DNA为模板进行PCR扩增:所用PCR引物为一对正向引物和反向引物,其PCR产物中含有检测相关位点,
正向引物为如SEQ ID NO.2所示: 5’-CACCATGGAGGTGGAAGAGT-3’,
反向引物为如SEQ ID NO.3所示: 5’-TCTGAGTGGCCATGTACAGC-3’;
(2)PCR的扩增产物进行LDR扩增;
(3)用测序仪的Genescan功能对LDR产物进行测试,分析得到的检测数据和扩增曲线图。
7.根据权利要求1所述的ABL1基因位点分型检测试剂盒的使用方法,其特征在于,所述步骤(1)中待测样品基因组DNA提取为常规的血基因组抽提方法。
8.根据权利要求 1-5中任一项所述肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒在检测ABL1基因中的应用。
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