[发明专利]肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒、使用方法及应用有效

专利信息
申请号: 201410240322.3 申请日: 2014-05-30
公开(公告)号: CN104152542A 公开(公告)日: 2014-11-19
发明(设计)人: 祁小飞 申请(专利权)人: 苏州大学附属第一医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 曹毅
地址: 215000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 肿瘤 abl1 基因 位点分型 检测 试剂盒 使用方法 应用
【权利要求书】:

1.肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,该检测试剂盒包括:PCR试剂和LDR试剂,所述的PCR试剂包括一对PCR正向引物和反向引物、双蒸水、聚合酶、聚合酶配套缓冲液、dNTP和MgCl2

所述正向引物如SEQ ID NO.2所示:5’-CACCATGGAGGTGGAAGAGT-3’;

所述反向引物如SEQ ID NO.3所示:5’-TCTGAGTGGCCATGTACAGC-3’。

2.根据权利要求1所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述LDR试剂包括相关位点的荧光探针、检测探针、双蒸水、Taq连接酶和连接酶配套缓冲液;所述聚合酶为Taq酶。

3.根据权利要求2所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述LDR所用荧光探针序列为:

5’-P-TGAGTTCATGACCTACGGGAACCTCTACCTACCTACCTACC-FAM-3’;所述LDR所用检测探针序列为:如SEQ ID NO.5所示5’-ACCTACCTACCTACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCAC-3’和如SEQ ID NO.6所示5’-CTACCTACCTACCTACCCGGGAGCCCCCGTTCTATATCATCAT-3’,所述连接产物长度分别为82和84。

4.根据权利要求1所述的肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述荧光标记的一部分为和模板配对部分,另一部分则可引入随机系列来调整LDR产物长度,所述荧光探针在3’进行荧光标记和5’端进行磷酸化标记;所述荧光探针的荧光基团为5-FAM、6-FAM、TAMRA、HEX、TET、JOE、VIC、NED、ROX、D1、D2、D3或D4。

5.根据权利要求2所述的ABL1基因位点分型检测试剂盒,其特征在于,所述检测探针的一部分为和模板配对部分,另一部分则可引入随机系列来调整LDR产物长度,所述检测探针根据突变位点的需要进行设计,检测探针为2-4根探针,检测探针中的3’端为检测位点。

6.肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒的使用方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

(1)提取待测样品基因组DNA,以待测样品基因组DNA为模板进行PCR扩增:所用PCR引物为一对正向引物和反向引物,其PCR产物中含有检测相关位点,

正向引物为如SEQ ID NO.2所示:   5’-CACCATGGAGGTGGAAGAGT-3’,

反向引物为如SEQ ID NO.3所示:   5’-TCTGAGTGGCCATGTACAGC-3’;

(2)PCR的扩增产物进行LDR扩增;

(3)用测序仪的Genescan功能对LDR产物进行测试,分析得到的检测数据和扩增曲线图。

7.根据权利要求1所述的ABL1基因位点分型检测试剂盒的使用方法,其特征在于,所述步骤(1)中待测样品基因组DNA提取为常规的血基因组抽提方法。

8.根据权利要求 1-5中任一项所述肿瘤ABL1基因位点分型检测试剂盒在检测ABL1基因中的应用。

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