[发明专利]基因DNA序列捕获探针的制备方法有效

专利信息
申请号: 201410064762.8 申请日: 2014-02-26
公开(公告)号: CN103898210A 公开(公告)日: 2014-07-02
发明(设计)人: 谭海芹;洪旭涛;余文菁;张珊珊;余科;宓娅娜 申请(专利权)人: 绍兴锐创生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 金祺
地址: 312071 浙江省绍兴市袍*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 基因 dna 序列 捕获 探针 制备 方法
【权利要求书】:

1.基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是包括以下步骤:

一、制备接头:

1)、设计两条部分互补的引物,所述两条引物之间的互补度为30~50%;其中一条引物中含有T7启动子序列且该条引物的5’末端有一个突出的T;

2)、配制反应液进行反应:

共100μl,混匀;

反应条件为:将上述混合液进行94℃保温10分钟,然后取出进行缓慢冷却至室温实现退火;从而形成一个部分双链结构的开叉形接头;

二、将上述部分双链结构的开叉形接头与目标基因的普通PCR扩增产物(A1)进行连接反应,从而得到两端带有接头的目标基因(A2);

所述反应体系为:

反应条件为16℃,1小时,从而得到两端带有接头的目标基因(A2);

三、针对部分双链结构的开叉形接头序列设计相应的引物-----2个通用引物,对所述两端带有接头的目标基因(A2)进行扩增,得到带有T7启动子的扩增产物(A3);

PCR反应体系如下:

PCR反应程序为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,62℃退火30秒,72℃延伸1分钟,共15个循环;然后72℃额外延伸10分钟,将所得的带有T7启动子的扩增产物(A3)4℃保存;

四、对上述带有T7启动子的扩增产物(A3)进行定量后,加入带有生物素标记的NTP,进行体外转录反应,最终得到基因DNA序列捕获探针;

所述NTP中,UTP上标记生物素,ATP、CTP、GTP不标记。

2.根据权利要求1所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:

所述步骤四中:

将扩增产物(A3)定量至浓度为22.6ng/μl;

体外转录体系为:

加去离子水至总体积40μl;

混匀后于37℃,反应15小时;所得产物纯化,得基因DNA序列捕获探针。

3.根据权利要求1或2所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:

所述步骤一中:

4.根据权利要求3所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:

所述步骤三中:

通用引物1:ACTCTTAATACGACTCACTATAGGGATCGCT

通用引物2:CGGCTTAATA CGACTCACTA TAGGGATCGC。

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