[发明专利]基因DNA序列捕获探针的制备方法有效
| 申请号: | 201410064762.8 | 申请日: | 2014-02-26 |
| 公开(公告)号: | CN103898210A | 公开(公告)日: | 2014-07-02 |
| 发明(设计)人: | 谭海芹;洪旭涛;余文菁;张珊珊;余科;宓娅娜 | 申请(专利权)人: | 绍兴锐创生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 312071 浙江省绍兴市袍*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基因 dna 序列 捕获 探针 制备 方法 | ||
1.基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是包括以下步骤:
一、制备接头:
1)、设计两条部分互补的引物,所述两条引物之间的互补度为30~50%;其中一条引物中含有T7启动子序列且该条引物的5’末端有一个突出的T;
2)、配制反应液进行反应:
共100μl,混匀;
反应条件为:将上述混合液进行94℃保温10分钟,然后取出进行缓慢冷却至室温实现退火;从而形成一个部分双链结构的开叉形接头;
二、将上述部分双链结构的开叉形接头与目标基因的普通PCR扩增产物(A1)进行连接反应,从而得到两端带有接头的目标基因(A2);
所述反应体系为:
反应条件为16℃,1小时,从而得到两端带有接头的目标基因(A2);
三、针对部分双链结构的开叉形接头序列设计相应的引物-----2个通用引物,对所述两端带有接头的目标基因(A2)进行扩增,得到带有T7启动子的扩增产物(A3);
PCR反应体系如下:
PCR反应程序为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,62℃退火30秒,72℃延伸1分钟,共15个循环;然后72℃额外延伸10分钟,将所得的带有T7启动子的扩增产物(A3)4℃保存;
四、对上述带有T7启动子的扩增产物(A3)进行定量后,加入带有生物素标记的NTP,进行体外转录反应,最终得到基因DNA序列捕获探针;
所述NTP中,UTP上标记生物素,ATP、CTP、GTP不标记。
2.根据权利要求1所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:
所述步骤四中:
将扩增产物(A3)定量至浓度为22.6ng/μl;
体外转录体系为:
加去离子水至总体积40μl;
混匀后于37℃,反应15小时;所得产物纯化,得基因DNA序列捕获探针。
3.根据权利要求1或2所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:
所述步骤一中:
4.根据权利要求3所述的基因DNA序列捕获探针的制备方法,其特征是:
所述步骤三中:
通用引物1:ACTCTTAATACGACTCACTATAGGGATCGCT
通用引物2:CGGCTTAATA CGACTCACTA TAGGGATCGC。
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