[发明专利]基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测试剂盒及其检测方法在审
| 申请号: | 201410041348.5 | 申请日: | 2014-01-28 |
| 公开(公告)号: | CN103757126A | 公开(公告)日: | 2014-04-30 |
| 发明(设计)人: | 张忠英;唐晶 | 申请(专利权)人: | 厦门大学附属中山医院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12M1/34;C12N15/11 |
| 代理公司: | 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) 35200 | 代理人: | 马应森 |
| 地址: | 361004 福建省厦*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 allglo 探针 荧光 定量 pcr microrna 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.检测miRNA的特异引物,其特征在于包括特异的逆转录引物和特异的正向引物;
所述特异的逆转录引物是指在核苷酸序列为SEQ ID NO.1 5'-GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGAC5'-末端加上与miRNA序列3'端8个反向互补的碱基;
所述特异的正向引物是指在miRNA的碱基序列去掉3'端8个碱基,同时在5'端加上6个碱基序列,其核苷酸序列为SEQ ID NO.2 5'-TCCCTC-3'。
2.基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测试剂盒,其特征在于设有盒体、隔板、miRNA提取试剂瓶、茎环逆转录试剂瓶、实时荧光定量PCR试剂瓶;隔板设在盒体内,miRNA提取试剂瓶、茎环逆转录试剂瓶、实时荧光定量PCR试剂瓶插在隔板上,miRNA提取试剂瓶内装有miRNA提取试剂,茎环逆转录试剂瓶内装有茎环逆转录试剂,实时荧光定量PCR试剂瓶内装有实时荧光定量PCR试剂。
3.如权利要求2所述基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测试剂盒,其特征在于所述miRNA提取试剂包括外源性参照cel-miR-39,其工作浓度为5n mol;所述cel-miR-39的核苷酸序列为SEQ ID NO.3 5'-UCACCGGGUGUAAAUCAGCUUG-3'。
4.如权利要求2所述基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测试剂盒,其特征在于所述茎环逆转录试剂包括以下组份:200单位/μL的MMLV酶、10m moldNTP混合液、5×RT缓冲液、40单位/μL的RNA酶抑制剂、10m mol的MgCl2、1μmol的特异的miRNA的逆转录引物、miRNA标准品,浓度为100n mol;
所述特异的miRNA的逆转录引物是指在核苷酸序列为SEQ ID NO.1 5'-GTCGTATCCAGTGCGTGTCGTGGAGTCGGCAATTGCACTGGATACGAC-5'末端加上与miRNA序列3'端8个反向互补的碱基;所述5×RT缓冲液由250m mol Tris-HCl,375m mol KCl,15m mol MgCl2,50m mol DTT组成。
5.如权利要求2所述基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测试剂盒,其特征在于所述实时荧光定量PCR试剂包括以下组份:10×Taq缓冲液、10m mol的MgCl2、5单位/μL的Taq聚合酶、10mM dNTP混合液、100ml无核酶水、10μmol特异正向引物、10μmol通用反向引物和AllGlo探针;所述特异正向引物为在miRNA的碱基序列去掉3'端8个碱基,同时在5'端加上6个碱基序列,其核苷酸序列为SEQ ID NO.2 5'-TCCCTC-3';所述通用反向引物为SEQ ID NO.4 5'-CAGTGCGTGTCGTGGAGT-3';所述AllGlo探针,其核苷酸序列为SEQ ID NO.5MAR-CACTGGATACGACGCTGCCG-MAR;所述10×Taq缓冲液包括100m mol Tris-HCl,500m mol KCl。
6.基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测方法,其特征在于包括以下步骤:
1)采用常规方法提取样本中miRNA,若为血清/血浆或其他体液样本,则在200μL样本充分裂解后加入基于AllGlo探针荧光定量PCR的miRNA检测试剂盒提供的浓度为5n mol的外源性参照cel-miR-39 5μL,立即漩涡震荡15s;若为细胞或组织样本,则无需加入外源性参照cel-miR-39;
2)应用基于AllGlo探针荧光定量PCR的miRNA检测试剂盒提供的茎环逆转录试剂将miRNA逆转录为cDNA;
3)应用基于AllGlo探针荧光定量PCR的miRNA检测试剂盒提供的实时荧光定量PCR试剂将cDNA进行实时荧光定量PCR扩增;
4)综合分析仪器给出的各项数据,设定合理的阈值和基线,进行结果分析。
7.如权利要求6所述基于AllGlo探针荧光定量PCR的microRNA检测方法,其特征在于所述AllGlo探针采用美国A1leLogic Biosciences Corporation公司的荧光定量探针。
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