[发明专利]一种两核苷酸实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法有效
| 申请号: | 201410009116.1 | 申请日: | 2014-01-09 |
| 公开(公告)号: | CN103740824A | 公开(公告)日: | 2014-04-23 |
| 发明(设计)人: | 肖鹏峰;浦丹 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/32;C12R1/33 |
| 代理公司: | 江苏永衡昭辉律师事务所 32250 | 代理人: | 王斌 |
| 地址: | 210096*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 核苷酸 实时 合成 图谱 鉴定 微生物 种群 方法 | ||
1.一种两核苷酸循环实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法,其特征在于,通过对微生物特定可变区的待测核苷酸序列进行两核苷酸循环的测序反应,由测序反应所得到的测序图谱确定微生物具体的菌株;所述的两核苷酸为dATPaS、dCTP、dTTP 、dGTP中的两种不同的核苷酸,所述两核苷酸循环测序反应指从(dATPaS+dCTP)/(dGTP+dTTP)、(dATPaS+dGTP)/(dCTP+dTTP)、 (dATPaS+dTTP)/(dCTP+dGTP)三组中选择其中一组进行两核苷酸循环测序反应,所述的测序反应得到的测序图谱包括参与合成反应的核苷酸种类(峰的类型),以及合成核苷酸的数目(峰的高度或者信号强度)。
2.根据权利要求1所述的一种两核苷酸循环实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法,其特征在于,所述的微生物特定可变区的待测核酸序列先通过PCR扩增后再进行两核苷酸循环实时合成测序。
3.根据权利要求1所述的一种两核苷酸循环实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法,其特征在于,所述测序图谱的特征包括峰的类型、峰的高度,以及峰的排列形式构成的全部信息。
4.根据权利要求1所述的一种两核苷酸循环实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法,其特征在于,dNTPs合成实时释放相同的检测分子,其检测分子是化学发光检测的焦磷酸盐,电化学检测的氢离子或者光学检测的荧光信号。
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