[发明专利]基于MPI的网格并行预处理方法有效
| 申请号: | 201410004273.3 | 申请日: | 2014-01-02 |
| 公开(公告)号: | CN104765589B | 公开(公告)日: | 2017-10-31 |
| 发明(设计)人: | 陈春艳;罗海飙;廖俊豪;王婷 | 申请(专利权)人: | 广州中国科学院软件应用技术研究所 |
| 主分类号: | G06F9/38 | 分类号: | G06F9/38;G06F17/30 |
| 代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司44100 | 代理人: | 肖云 |
| 地址: | 511458 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 mpi 网格 并行 预处理 方法 | ||
1.一种基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于,包括以下步骤:
给定计算域的网格的分区数;
启动MPI多进程,设定进程数;
判断进程数是否等于分区数,若等于则打开网格文件,主进程读取网格单元信息文件,将网格单元平均初始分配到各个进程,每个进程创建网格单元的邻接数组,否则重新启动MPI多进程;
每个进程调用ParMETIS对网格单元进行网格划分;
每个进程将网格单元信息分块读到数组,设定数组的索引位置;
每个进程循环遍历网格单元信息文件,判断数组长度减去数组的索引位置号是否小于网格单元信息长度,若小于则读取网格单元信息文件的数据填充到数组中,否则将数组元素赋值给网格单元,并修改数组的索引位置;
判断网格单元的分区号是否等于进程号,若等于则将网格单元信息存储到进程文件中,否则修改数组索引位置,继续循环判断。
2.如权利要求1所述的基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于:计算域的网格的分区数小于或等于并行计算机的处理器数。
3.如权利要求1所述的基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于:邻接数组的存储格式为CSR。
4.如权利要求1所述的基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于:每个进程调用ParMETIS的子程序ParMETIS_V3_Mesh2Dual,将网格单元转化成图。
5.如权利要求4所述的基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于:每个进程调用ParMETIS的子程序ParMETIS_V3_AdaptiveRepart,对图进行重划分。
6.如权利要求5所述的基于MPI的网格并行预处理方法,其特征在于:每个进程调用ParMETIS的子程序ParMETIS_V3_RefineKway,进一步精化网格划分的质量。
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