[发明专利]用于观察生物物种的方法

说明书

本发明涉及一种用于观察在培养基(MC)上的生物物种(CB)的方法，该培养基(MC)被容纳在具有至少一个半透明面(CP，BU)的容器内，所述方法包括以下步骤：a)使光束(FL)射向所述半透明面的一部分上，以在所述半透明面上界定出至少一个被照亮的部位(M1)和至少一个未被照亮的部位(MO)；以及b)获取所述培养基的表面被所述光束照亮的部分(M2)的图像，所述获取透过所述半透明面的所述未被照亮的部位(MO)或至少一个所述未被照亮的部位(MO)并且沿光学获取轴进行，该光学获取轴与所述光束的传播方向形成非零角度(α)。

技术领域

本发明涉及一种用于观察，并且适当情况下用于检测，在培养基上的生物物种的方法，该培养基被容纳在诸如皮氏培养皿的容器内。

背景技术

通常将诸如细菌的微生物培养在培养基(琼脂)上，其中培养基(琼脂)被容纳在皮氏培养皿内。皮氏培养皿为不是很深的圆柱状培养皿，由基底和盖子组成，由诸如玻璃或塑料(聚苯乙烯)的透明材料制成。通常在均匀照明下，通过肉眼观察来检测微生物；细菌菌落通常显现为或多或少的弧形材料簇，该材料簇可以透过皮氏培养皿的壁或底部看到。由于存在冷凝物薄层，通常难以或不能透过盖子进行观察，其中冷凝物薄层由直径大约在1μm至1mm之间的弥散的微滴构成，这些微滴覆盖了所述盖子的内表面。因此，当培养基为散射的或吸收性的(在血琼脂的情况下)时，需要打开皮氏培养皿以观察培养的微生物，但是这样存在污染的风险。

本发明的目标是要解决这一问题。更具体地，本发明的目标是提供一种方法，该方法使得能够透过容器的半透明面(并且因此为散射的面)，观察容纳在该容器内的培养基上的生物物种，该面可能由于散射材料(尤其是冷凝物)沉积在其上而是半透明的。

发明内容

根据本发明，该目标是利用如下方法实现的：一种用于观察在培养基上的生物物种的方法，该培养基被容纳在具有至少一个半透明面的容器内，该方法包括以下步骤：

a)使光束射向所述半透明面的一部分上，以界定出所述半透明面的至少一个被照亮的部位和至少一个未被照亮的部位；以及

b)获取所述培养基的表面被所述光束照亮的部分的图像，所述获取透过所述半透明面的所述未被照亮的部位或至少一个所述未被照亮的部位并且沿光学获取轴进行，该光学获取轴与所述光束的传播方向形成非零角度。

有利地，在界定出所述半透明面的不同的被照亮的部位和未被照亮的部位的同时，步骤a)和步骤b)可以进行多次，该方法还包括步骤c)：组合由此获取的图像，以形成“组合”图像。

具体地，步骤a)和步骤b)可以进行多次，然后光束扫描培养基的表面。在光束的每一连续位置处，获取图像，然后处理这些图像以形成组合图像。然后，组合图像构成培养基的描述。

例如，所述组合图像可以通过以下过程获得：在培养基的表面的每一点处，组合在所述获取的图像上测量的对应于该点的最弱的光强度。

所述组合图像还可以通过以下过程获得：鉴定出每一个获取的图像的感兴趣的部位，然后组合所述感兴趣的部位以形成组合图像。

具体地，感兴趣的部位可以包括光束在培养基上的投影。例如，感兴趣的部位可以对应于光束在培养基上的投影。优选地，所述感兴趣的部位不包括光束在半透明面上的投影。

在上述步骤a)和步骤b)之后，可以提取图像的感兴趣的区域，该图像的感兴趣的区域包括光束在培养基上的投影。优选地，该提取的感兴趣的区域不包括光束在容器的半透明面上的投影。

所述方法还可以包括步骤d)：通过辨别在所述图像或组合图像上的明亮部位或黑暗部位，检测所述生物物种。该检测能够通过操作者进行，或通过执行图像处理软件的计算机自动进行。该检测能够伴随对菌落进行计数，并且还能够伴随根据给定标准，例如它们的表面积，对其进行分类。