[发明专利]一种用于检测KRAS基因热点突变的试剂盒及其检测方法有效
| 申请号: | 201310466108.5 | 申请日: | 2013-10-09 |
| 公开(公告)号: | CN103571947A | 公开(公告)日: | 2014-02-12 |
| 发明(设计)人: | 叶伦;李雪梅;付金玲;陈刚 | 申请(专利权)人: | 武汉康录生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 湖北武汉永嘉专利代理有限公司 42102 | 代理人: | 邬丽明 |
| 地址: | 430075 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 用于 检测 kras 基因 热点 突变 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种用于检测KRAS基因热点突变的试剂盒,其特征在于,包括PCR反应液、PNA试剂、酶消化液、测序反应液、磁珠和产物纯化液,所述PCR反应液包含PCR缓冲液、dNTPs、PCR正向引物、PCR反向引物、探针和DNA聚合酶,所述PCR正向引物的序列为SEQ.ID NO.1,所述PCR反向引物的序列为SEQ.ID NO.2,所述探针的序列为SEQ.ID NO.3,所述探针的5’端的荧光基团为FAM,3’端的荧光基团为BHQ1;所述PNA的序列为SEQ.ID NO.4;所述测序反应液包含Bigdye、Bigdye缓冲液和测序引物。
2.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述PCR缓冲液由100mmol/LTris-HCl、500mmol/L KCl和15mmol/L MgCl2组成;所述dNTPs的摩尔浓度为2.5mmol/L dNTPs;所述PCR正向引物的摩尔浓度为10μmol/L,所述PCR反向引物的摩尔浓度为10μmol/L;所述探针的摩尔浓度为10μmol/L;所述DNA聚合酶的酶活力单位浓度为5U/μl;所述PNA试剂的摩尔浓度为10μmol/L。
3.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于所述酶消化液包括核酸外切酶Ⅰ和碱性磷酸酶。
4.根据权利要求3所述试剂盒,其特征在于所述核酸外切酶Ⅰ和碱性磷酸酶的酶活力单位比为5:2。
5.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于,所述测序反应液含有5×Bigdye、2.5×Bigdye缓冲液和3μmol/L的测序引物。
6.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于所述产物纯化液为0.75M氯化钠溶液。
7.根据权利要求1所述试剂盒,其特征在于在所述PCR正向引物的5’端
插入通用M13序列:TGTAAAACGACGGCCAGT,在所述PCR反向引物的5’端插入通用M13序列:CAGGAAACAGCTATGACC,则所述的测序引物序列为:TGTAAAACGACGGCCAGT。
8.一种使用权利要求1~7所述试剂盒检测KRAS基因热点突变的方法,其特征在于它包括如下步骤:
(1)目的基因荧光定量PCR扩增:使用试剂盒中的PCR反应液和PNA试剂,对样品DNA进行PCR扩增反应,得到目的基因的荧光定量结果和PCR产物;
(2)根据步骤(1)中的定量结果,使用试剂盒中的酶消化液,对步骤(1)得到的PCR产物进行纯化,得到纯化后PCR产物;
(3)使用试剂盒中的测序反应液,对步骤(2)得到的纯化后PCR产物进行测序PCR反应,得到测序PCR产物;
(4)使用试剂盒中的磁珠和产物纯化液,对步骤(3)得到的测序PCR产物进行纯化,得到纯化后测序PCR产物;
(5)将步骤(4)得到的纯化后测序PCR产物加样至测序仪进行序列分析,测序所得基因序列与KRAS基因标准序列进行比对,并查看峰图,判断是否存在KRAS基因热点突变。
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