[发明专利]一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测方法及其试剂盒有效
| 申请号: | 201310430466.0 | 申请日: | 2013-09-18 |
| 公开(公告)号: | CN103484568A | 公开(公告)日: | 2014-01-01 |
| 发明(设计)人: | 曾伟伟;王庆;吴淑勤;王英英;刘春;梁红茹;石存斌;李莹莹 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹 |
| 地址: | 510380 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 草鱼 呼肠孤 病毒 双重 荧光 定量 pcr 检测 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测试剂盒包括如下成分:双重荧光定量反应液、酶混合液、RT-PCR 反应液、阳性质控品和无RNA 酶去离子水,其特征在于:所述双重荧光定量反应液中含有草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型特异性引物及双重探针,序列分别为:
草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型:
上游引物:GCRV-Ⅰ-F:5’-CTCTCTGGCAGAAACACTTAGAC-3’;
下游引物:GCRV-Ⅰ-R:5’-CGTTGTAGAACTCATTTGGGTAGG-3’ ;
荧光探针:
GCRV-Ⅰ-P:5’-FAM-CCGCCATGACCATGCTAACACCTGACA-BHQ1-3’;
草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型:
上游引物:GCRV-Ⅱ-F:5’-TGATGAGTTCAGTGCCTACG-3’;
下游引物:GCRV-Ⅱ-R:5’-GAGCCATGAGGTGTGTCTAC-3’;
荧光探针:
GCRV-Ⅱ-P:5’-CY5-ATCATAGCAGCCGCCGTCCGTAT-BHQ1-3’;
草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型的荧光探针报告基团为FAM,草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型的荧光探针报告基团为CY5,淬灭基团为BHQ1。
2.根据权利要求1所述的一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:所述双重荧光定量反应液的组成如下:
GCRV-Ⅰ-F(100μM) 5μL
GCRV-Ⅰ-R(100μM) 5μL
GCRV-Ⅰ-P(100μM) 4μL
GCRV-Ⅱ-F(100μM) 6μL
GCRV-Ⅱ-R(100μM) 6μL
GCRV-Ⅱ-P(100μM) 5μL
无RNA酶去离子水 169μL
Total 200μL。
3.根据权利要求1所述的一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:所述酶混合液包括逆转录酶和Taq 酶。
4.根据权利要求1所述的一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:所述阳性质控品为灭活的草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型GCRV09-01株和Ⅱ型GCRV-HZ08株的培养液。
5.一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)提取待测样品中的病毒RNA;
2)以提取的RNA为模板,使用草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型的
上游引物:GCRV-Ⅰ-F:5’-CTCTCTGGCAGAAACACTTAGAC-3’;
下游引物:GCRV-Ⅰ-R:5’-CGTTGTAGAACTCATTTGGGTAGG-3’;
荧光探针:GCRV-Ⅰ-P:5’-FAM-CCGCCATGACCATGCTAACACCTGACA-BHQ1-3’和草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型的
上游引物:GCRV-Ⅱ-F:5’-TGATGAGTTCAGTGCCTACG-3’;
下游引物:GCRV-Ⅱ-R:5’-GAGCCATGAGGTGTGTCTAC-3’;
荧光探针:GCRV-Ⅱ-P:5’-CY5-ATCATAGCAGCCGCCGTCCGTAT-BHQ1-3’
进行双重荧光定量PCR检测,其中,草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型的荧光探针报告基团为FAM,草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型的荧光探针报告基团为CY5,淬灭基团为BHQ1;
3)结果分析:反应结束后,根据待测样品的荧光Ct值判断待测样品是否为草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型、草鱼呼肠孤病毒Ⅱ型阳性。
6.根据权利要求5所述的一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:所述双重荧光定量PCR的反应体系包括病毒RNA模板、双重荧光定量反应液、酶混合液、RT-PCR 反应液和无RNA 酶去离子水。
7.根据权利要求5所述的一种草鱼呼肠孤病毒Ⅰ型和Ⅱ型的双重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:所述双重荧光定量PCR的反应条件为42℃ 30min,94~96℃ 3~8min,然后经94~96℃ 7~10s和58~62℃ 32~38s采集荧光信号40个循环。
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