[发明专利]FoxH1基因SNP位点的用途

说明书

技术领域

本发明属于生物医药技术领域，具体涉及FoxH1基因SNP位点的用途及相关试剂盒。

背景技术

先天性心脏病(简称先心病，congenital heart defects，CHDs)是指胎儿发育时期(怀孕初期2-3个月内)，心脏及大血管在母体内发育有缺陷或部分发育停顿所造成的畸形，或出生后本应自动关闭的通道未能闭合(在胎儿属正常)的一种出生缺陷性疾病。先天性心脏病(以下简称为CHDs)是人类所有出生缺陷中最为常见的疾病之一。国外资料显示，CHDs的发病率为1‰，国内统计为发病率占新生活产婴儿6.87‰～14.39‰。

先天性心脏病有很多种类型，包括简单和复杂的先心病。简单的先心病有以下三种：室间隔缺损(ventricular septal defect，VSD)、房间隔缺损(attial septaldefect，ASD)、动脉导管未闭(patent ductus arteriosus，PDA)。复杂的先心病主要包括以下几种：法洛四联症(tetralogy of Fallot，TOF)、肺动脉瓣狭窄(pulmonary stenosis，PS)、大动脉异位(transposition of the great arteries，TGA)、主动脉缩窄(aortic stenosis，AS)、右室双出口(double-outlet right ventricle，DORV)，房室传导阻滞(atrioventricular block，AVB)等。其中室间隔缺损(以下简称为VSD)在CHDs中的发病率在新生儿中约为20％，在儿童中约为30％，是所有CHDs中发病率最高的一种。VSD是具体指室间隔在胚胎发育不全，在左、右心室之间存在一直接开口，产生左向右分流，可单独发生，形成单纯性室间隔缺损，也可是某种复杂心脏畸形的组成部分，形成非单纯性室间隔缺损。这种心脏缺损会导致左心室的富氧血液流入右心室而不是正常流入主动脉。甘肃省六地市2-19岁人群中CHDs调查表明总患病率为0.571％，其中VSD占52.72％。尽管大多数VSD可通过手术方式来纠正，但手术治疗会给患儿家庭和社会带来沉重的经济负担；况且VSD患者术后发生心脏功能异常的机率与正常人比会大大增加。因此，寻找VSD相关基因，用于产前诊断和基因治疗，最大程度地避免VSD患儿出生和纠正遗传缺陷，是当前心血管领域研究重点。先天性心脏病与自然环境、细菌、病毒、遗传及精神状态等因素密切相关。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)是指存在于某一(些)群体、正常个体的基因组DNA中单碱基的序列差异，并且在人群中的分布频率至少要在1％以上(Brookes AJ.Gene，1999，234(2)：177-186)，人类遗传基因的多态性在遗传信息上的本质表现，90％以上是由SNP所引起的。因为其多态信息量大，目前已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志。

从基础医学到临床医学的各个领域，SNP都存在巨大的应用价值。SNP的研究为基因诊断，尤其是疾病的早期诊断提供更多依据有重要意义。SNP由于其分布广、密度高而被期望在诸如癌症、糖尿病、高血压、忧郁症和哮喘等复杂疾病的研究中起重要作用，这些复杂疾病是多个遗传变异位点与环境因子共同作用的结果，由于发病原因复杂，涉及的基因数量多，已成为国际上疾病基因组学研究的重点。全基因组关联研究已经证实单核苷酸多态性增加了某些常见疾病的易感性，如癌症，糖尿病和冠状动脉性疾病，但对先心病的研究尚处于初期阶段。目前，单核苷酸多态性与先心病的关联研究都集中在检测候选基因多态性上，如叶酸代谢通路基因与先心病易感性的研究，在多项研究中都发现叶酸代谢过程中重要的亚甲基四氢叶酸还原酶基因中的一个SNP(C677T)可导致酶的活性下降，但是这个结论在一项Meta分析中并未得到确定。另外，血管内皮生长因子(VEGF)已被证明是正常心脏发育的关键基因，而VEGF的三个SNP(C2578A，G1154A，C634G)被认为与22q11缺失综合征、TOF及VSD有关，但是和MTHFR一样，Meta分析依然未能证实它们之间的关系，这可能和样本量大小、基因频率、统计效力及先心病表型的异质性有关。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是为先天性心脏病易感性的诊断或先天性心脏病药物的个体化治疗提供解决方法和相应的试剂盒。

本发明的解决方案之一是：FoxH1基因SNP位点rs750472在制备先天性心脏病易感性的诊断试剂盒中的应用。