[发明专利]罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法及其检测试剂盒有效
| 申请号: | 201310305396.6 | 申请日: | 2013-07-19 |
| 公开(公告)号: | CN103409555A | 公开(公告)日: | 2013-11-27 |
| 发明(设计)人: | 林锋;沈锦玉;刘莉;曹铮;郝贵杰;盛鹏程;吴颖蕾 | 申请(专利权)人: | 浙江省淡水水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 杭州杭诚专利事务所有限公司 33109 | 代理人: | 尉伟敏 |
| 地址: | 313001 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 罗氏沼虾野田村 病毒 rt lamp lfd 检测 方法 及其 试剂盒 | ||
1.一种罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法,其特征在于:包括如下步骤:
病毒RNA的提取:
(1)取20-30mg罗氏沼虾幼虾或成虾肌肉组织,加入350-500μL裂解液匀浆,离心;
(2)取步骤(1)离心所得上清液,与等体积的70%无水乙醇混合均匀后,将混合液与玻璃纤维素膜结合;
(3)依次用去蛋白液和漂洗液洗涤玻璃纤维素膜;
(4)用RNase free water洗脱玻璃纤维素膜上吸附的RNA;
RT- LAMP扩增反应:
(5)配制预反应液,所述预反应液体积为16-21μL,包括:1.4-2.0mmol/L 引物MrNV-FIP,1.4-2.0mmol/L引物MrNV-BIP,0.2mmol/L 引物MrNV-F3,0.2mmol/L引物MrNV-B3,0.05-0.15μmol/L 探针MrNV-FITC-PROBE,10-30mmol/L pH8.0-9.0的Tris-HCl,10-20mmol/L 氯化钾,10-20 mmol/L 硫酸铵,5-10mmol/L 硫酸镁,0.1-0.3% Triton X-100,0.4-0.8mol/L 甜菜碱,1.4-1.6mmol/L dNTP,1-2U逆转录酶AMV,6-10U Bst DNA 聚合酶大片段;
引物MrNV-FIP序列见SEQ ID NO:1,引物MrNV-BIP序列见SEQ ID NO:2,引物MrNV-F3序列见SEQ ID NO:3,引物MrNV-B3序列见SEQ ID NO:4,探针MrNV-FITC-PROBE序列见SEQ ID NO:5;
(6)在16-21μL预反应液中加入4-9μL步骤(4)所得 RNA作为模板,控制反应体系总体积为20-25μL,然后在60℃-65℃下反应15-60min;
LFD试纸检测:
(7)取步骤(6)所得RT- LAMP扩增反应产物5-10μL滴到LFD试纸的点样处,然后在点样处前端滴上50-100μL缓冲液,5-15分钟后根据试纸条上的显色带判定检测结果。
2.根据权利要求1所述的罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法,其特征在于:所述裂解液包括浓度为30-60mmol/L 的pH7.3-7.6 Tris-HCL,浓度为3-6mol/L的异硫氰酸胍,以及浓度为5-10mmol/L EDTA。
3.根据权利要求1所述的罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法,其特征在于:所述去蛋白液包括浓度为10-50mmol/L的pH7.3-7.6 Tris-HCL,浓度为0.4-0.6mol/L异硫氰酸胍,以及体积浓度为10-30%的无水乙醇。
4.根据权利要求1所述的罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法,其特征在于:所述漂洗液包括浓度为10-50mmol/L的pH7.3-7.6 Tris-HCL,50-150mmol/L NaCl,以及体积浓度75%的无水乙醇。
5.根据权利要求1或2或3或4所述的罗氏沼虾野田村病毒RT-LAMP-LFD检测方法,其特征在于:引物MrNV-FIP为5’端生物素标记引物;探针MrNV-FTIC-PROBE为5’端FITC标记探针。
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