[发明专利]用于人乳头瘤病毒18基因检测的生物试剂有效

专利信息
申请号: 201310294174.9 申请日: 2013-07-12
公开(公告)号: CN103540683A 公开(公告)日: 2014-01-29
发明(设计)人: 钟建;方平科 申请(专利权)人: 钟建
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68
代理公司: 北京攀腾专利代理事务所(普通合伙) 11374 代理人: 彭蓉
地址: 美国麻*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 用于 乳头 病毒 18 基因 检测 生物 试剂
【说明书】:

技术领域

发明涉及分子生物学领域的基因检测技术,尤其涉及用于人乳头瘤病毒18(HPV18)基因检测的生物试剂、其制备方法以及基因的检测方法。

背景技术

人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)是一种最小的DNA(脱氧核糖核酸)病毒。HPV呈球形,直径约为45~55nm,具有嗜上皮性,在人和动物中分布广泛。HPV在自然界中广泛存在,人类感染HPV十分普遍,感染率也很高。综合国外一些报道,在自然人群中HPV感染率从低于1%到高达50%,在性活跃人群中20%~80%以上的人有HPV感染史。

HPV病毒在临床上可分为许多的亚型,而不同亚型的病毒可能导致不同的疾病。另外,根据致病力的程度或危险性大小,可将不同的亚型分为低危和高危两大类,其中HPV高危亚型的感染会引起生殖器癌和子宫颈癌上皮细胞病变。人乳头瘤病毒18(HPV18)属于高危亚型,是宫颈癌的重要致病因素。

目前宫颈癌的筛查主要是基于细胞学的检测方法,有宫颈巴氏(Pap)涂片、阴道镜活检、液基薄层细胞学或薄片制备细胞学检查(TCT)等多种。

宫颈巴氏涂片是群体筛查的常规手段,但受取材、涂片制作质量、阅片技术影响,准确性低,假阳性率高,重复性差,敏感性也有限,漏诊率可达30%。TCT法会引起不适、操作不便、费用高,不易为广大患者接受。宫颈组织活检有创伤,不利于人群普查。

发明内容

本发明的目的在于提供一种具有特异性强、灵敏度高的检测试剂盒,用于快速检测人乳头瘤病毒18(HPV18)类型。HPV18检测简单易行,标本可由医生采集或患者自取,是对细胞学检测方法的重要补充。

为实现上述目的,本发明提供了一种用于人乳头瘤病毒18型(HPV18)基因检测的生物试剂、其制备方法以及在基因检测的方法。

一方面,本发明提供了一种用于HPV18基因检测的试剂盒。所述试剂盒的组分包括:引物、探针、Taq聚合酶、10×buffer缓冲液、dNTP、试验标准品、阴性质控品和超纯水。

其中,合成的引物是由包括CPG、四氮唑、乙酸酐和1-甲基咪唑、碘、dNTP的原料合成。根据HPV的不同分型设计不同引物和探针。

另一方面,本发明还提供了用于HPV18基因检测的试剂盒的制备方法,其包括下述步骤:

1)确定待测基因片段:根据科技文献的方向性报道初步选定候选基因片断,然后经研发过程中与待检样本病理相关性的比较,最终确认与临床疾病最具相关性的待测基因片断;

2)根据所述待测基因片段设计并生产引物和探针,采用多核苷酸合成仪生产所述引物;

3)提取细胞基因组DNA:用DNA提取液提取病人基因组及对照组基因组DNA;

4)确定PCR扩增条件,其包括酶、探针、引物、基因组DNA用量及PCR的扩增条件:不同组合的引物片断,根据实验结果的特异性,敏感性等技术特征,反复试验,同时进行多条所述待测基因片断的检测反应,最终确定包括所述引物、探针最佳浓度及酶的最佳反应条件,其中,PCR基因扩增的结果由荧光PCR仪来检测;

5)进行重复性检测以进一步确定反应条件:通过大量实验,反复比较实验结果中包括清晰度和灵敏性的因素,最终确定反应条件;

6)根据最终确定的所述反应条件,制备试剂盒,其组分包括:引物、探针、dNTP、10×buffer缓冲液、Taq聚合酶、试验标准品、阴性质控品和超纯水。

又一方面,本发明还提供了采用本发明试剂盒进行HPV18基因检测的方法。

采用本发明的试剂盒进行HPV18基因检测,其中所述试剂盒的组分包括:细胞提取液、引物、探针、dNTP、10×buffer缓冲液、Taq聚合酶、试验标准品、阴性质控品和超纯水。

本发明以用基因组提取试剂盒提取的患者的细胞基因组DNA为模板,用试剂盒提供的引物、探针、dNTP、酶、试剂标准品等组分,20μL反应体系,按照特定的比例分别加入,采用PCR基因扩增技术,实现对HPV的基因检测。

具体检测步骤如下:

1)试剂准备:取PCR反应液备用。

2)加样:向准备好试剂的0.2ml离心管中,分别加入处理后的样品(包括标本和阳性质控品)上清液1μl,8,000rpm离心数秒,放入仪器样品槽。3)程序编辑:按对应顺序设置阴性质控品、以及未知标本(含阳性质控品),并在样本参数中设置样品名称。设置程序后运行。

本发明的技术关键涉及引物和探针的设计、合成和纯化以及细胞提取液的配置和标准品的制备。

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