[发明专利]基于电化学-DNA反应控制芯片的酸碱法扩增DNA片段技术在审
| 申请号: | 201310231925.2 | 申请日: | 2013-06-09 |
| 公开(公告)号: | CN104232615A | 公开(公告)日: | 2014-12-24 |
| 发明(设计)人: | 张一;刘刚;黄庆;樊春海 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海应用物理研究所 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12M1/34;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 祝莲君;雷芳 |
| 地址: | 201800 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 电化学 dna 反应 控制 芯片 酸碱 扩增 片段 技术 | ||
1.一种扩增核酸的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1a)变性步骤:在pH10-14的碱性条件下,使得扩增体系中的双链核酸分子解链;
(1b)复性和延伸步骤:在pH5-8的中性和近中性条件下,使得扩增体系中的单链核酸分子与引物进行复性,和在核酸聚合酶存在下,使结合于的单链核酸分子的引物进行延伸,形成扩增的双链核酸分子。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的核酸聚合酶为具有DNA聚合酶活性的酶类,较佳地,所述的核酸聚合酶包括:大肠杆菌DNA聚合酶I、Klenow片段(DNA聚合酶I大片段)、大肠杆菌DNA聚合酶II、大肠杆菌DNA聚合酶III、T4DNA聚合酶、T7DNA聚合酶、DNA聚合酶α、DNA聚合酶β、DNA聚合酶γ、DNA聚合酶δ、Taq DNA聚合酶、Tth DNA聚合酶、pfu DNA聚合酶、Vent DNA聚合酶、Bca Best DNA聚合酶、Sac DNA聚合酶、Iproof DNA聚合酶、KOD DNA聚合酶、Phusion DNA聚合酶、UlltraPFTMDNA聚合酶、LATag DNA聚合酶、Super Tag DNA聚合酶。
3.一种扩增核酸的设备,其特征在于,所述设备包括:
(3i)用于放置进行核酸扩增反应的容器的装置,所述容器用于容纳进行核酸扩增反应的扩增体系;
(3ii)碱性溶液添加装置,所述碱性溶液添加装置用于向所述扩增体系添加碱性溶液,从而调节扩增体系的PH至碱性条件;
(3iii)酸性溶液添加装置,所述酸性溶液添加装置用于向所述扩增体系添加酸性溶液,从而调节扩增体系的PH至酸性或中性条件;
(3iv)pH测量装置,所述的pH测量装置用于精确控制体系pH值。
4.一种扩增核酸的设备,其特征在于,所述设备包括:
(4i)用于放置进行核酸扩增反应的容器的扩增装置,其中,所述容器用于容纳进行核酸扩增反应的扩增体系;
(4ii)电化学工作站,所述电化学工作站用于调控及检测反应体系的pH值。
5.如权利要求4所述的设备,其特征在于,所述的扩增装置为微流控芯片。
6.一种扩增核酸的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)提供一扩增体系,所述扩增体系包括待扩增DNA模板、引物、dNTP、镁离子、和聚合酶;和
(2)通过电化学方法,调整扩增体系的pH值,从而实现核酸分子的变性和复性,并进行核酸扩增。
7.如权利要求6所述的扩增核酸的方法,其特征在于,所述方法包括:
在步骤(1)中,提供如权利要求4所述的扩增核酸的设备,并将待扩增DNA模板、引物、dNTP、镁离子、聚合酶加入所述设备中的扩增装置中,构成扩增体系;和
在步骤(2)中,所述的电化学方法是使用电化学工作站。
8.一种应用电化学的方法扩增核酸的方法,其特征在于,所述方法包括选自下组的一个或多个步骤:
在扩增溶液体系中测定电学参数和溶液pH的关系;
设定电学参数,通过溶液电化学反应将pH控制在10-14的碱性条件,使得扩增体系中的双链核酸分子解链;
设定电学参数,通过溶液电化学反应将pH控制在5-8的中性和近中性条件,使得扩增体系中的单链核酸分子与引物进行复性,并在核酸聚合酶存在下,使结合于的单链核酸分子的引物进行延伸,形成扩增的双链核酸分子。
9.一种核酸的检测方法,其特征在于,包括:
用如权利要求1、6或8所述的方法,对待测核酸进行扩增;和
对扩增后的核酸进行检测。
10.一种对核酸分子进行变性-复性的方法,其特征在于,包括:
(10a)提供一含核酸分子的反应体系;
(10b)调控反应体系pH至pH=10~14,从而使DNA进行变性;以及调控反应体系的pH至pH=5~8,从而使DNA进行复性;
其中,所述上述变性-复性过程可循环进行。
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