[发明专利]越野他汀的生物合成基因簇及其应用

权利要求书

1.一种越野他汀的生物合成基因簇，其特征在于，所述基因簇包括编码越野他汀生物合成所涉及的55个基因，具体为：

1)II型聚酮合成酶PKS相关基因：kstA1，kstA2，kstA3，kstD1，kstD2，kstD3，kstD4，kstD5，kstD6，kstD7，kstD8，kstD9，kstD10，kstD11，kstD12，kstD13，kstD14；共17个基因：

kstA1位于基因簇核苷酸序列第9943-11505位，编码腺苷酰化酶，长度为422个氨基酸；

kstA2位于基因簇核苷酸序列第11507-11770位，编码肽酰载体蛋白(PCP)，长度为402个氨基酸；

kstA3位于基因簇核苷酸序列第26548-26805位，编码酰基载体蛋白，长度为85个氨基酸；

kstD1位于基因簇核苷酸序列第9140-9946位，编码2,3-环环化酶，长度为268个氨基酸；

kstD2位于基因簇核苷酸序列第20823-216026位，编码酮基还原酶，长度为259个氨基酸；

kstD3位于基因簇核苷酸序列第22658-21699位，编码芳香化酶，长度为319个氨基酸；

kstD4位于基因簇核苷酸序列第23481-22696位，编码C-9位酮基还原酶，长度为261个氨基酸；

kstD5位于基因簇核苷酸序列第23591-24049位，编码单氧化酶，长度为152个氨基酸；

kstD6位于基因簇核苷酸序列第26861-27295位，编码第四环环化酶，长度为144个氨基酸；

kstD7位于基因簇核苷酸序列第27391-28233位，编码NAD(P)H:黄素氧化还原酶，长度为280个氨基酸；

kstD8位于基因簇核苷酸序列第28260-29156位，编码单氧化酶，长度为298个氨基酸；

kstD9位于基因簇核苷酸序列第32267-33358位，编码羧酸酯酶，长度为363个氨基酸；

kstD10位于基因簇核苷酸序列第32267-33358位，编码第四环环化酶，长度为150个氨基酸；

kstD11位于基因簇核苷酸序列第52203-51685位，编码脱氢酶，长度为172个氨基酸；

kstD12位于基因簇核苷酸序列第54953-54498位，编码羟化酶，长度为151个氨基酸；

kstD13位于基因簇核苷酸序列第60078-58579位，编码FAD依赖的或者包含BBE结构域的氧化还原酶，长度为499个氨基酸；

kstD14位于基因簇核苷酸序列第60258-61118位，编码甲基转移酶，长度为286个氨基酸；

2)非核糖体聚肽合成酶NRPS相关基因：kstB1，kstB2，kstE1，kstE2，kstE3，kstE4，kstE5，kstE6；共8个基因：

kstB1位于基因簇核苷酸序列第9943-11505位，编码NRPS腺苷化酶，长度为520个氨基酸；

kstB2位于基因簇核苷酸序列第11507-11770位，编码酰基载体蛋白，长度为87个氨基酸；

kstE1位于基因簇核苷酸序列第13618-13992位，编码L-ectoine合成酶，长度为124个氨基酸；

kstE2位于基因簇核苷酸序列第14017-15156位，编码酰基辅酶A脱氢酶，长度为379个氨基酸；

kstE3位于基因簇核苷酸序列第55079-55924位，编码羟化酶，长度为281个氨基酸；

kstE4位于基因簇核苷酸序列第58555-57470位，编码双氧化酶，长度为361个氨基酸；

kstE5位于基因簇核苷酸序列第61163-61852位，编码氨基转移酶，长度为229个氨基酸；

kstE6位于基因簇核苷酸序列第63435-64280位，编码脱甲酰酶，长度为281个氨基酸；

3)乙酰化的糖基合成相关基因：kstC1，kstC2，kstC3，kstC4，kstC5，kstC6，kstC7，kstC8，kstC9；共9个基因：

kstC1位于基因簇核苷酸序列第19574-18678位，编码dTDP-葡萄糖合成酶，长度为298个氨基酸；

kstC2位于基因簇核苷酸序列第19786-20775位，编码dTDP-葡萄糖-4,6-脱水酶，长度为329个氨基酸；

kstC3位于基因簇核苷酸序列第37944-37360位，编码3,5-表异构酶，长度为194个氨基酸；

kstC4位于基因簇核苷酸序列第38165-39175位，编码糖基转移酶辅助蛋白，长度为336个氨基酸；

kstC5位于基因簇核苷酸序列第39198-40496位，编码糖基转移酶，长度为432个氨基酸；

kstC6位于基因簇核苷酸序列第40496-41992位，编码2,3-己糖脱水酶，长度为498个氨基酸；

kstC7位于基因簇核苷酸序列第41989-43014位，编码丙酮酸脱氢酶α亚基，长度为341个氨基酸；

kstC8位于基因簇核苷酸序列第43031-44068位，编码丙酮酸脱氢酶β亚基，长度为345个氨基酸；

kstC9位于基因簇核苷酸序列第53344-52361位，编码己糖-3-酮基还原酶，长度为327个氨基酸；

4)负责吡咯吡咯二并环形成的后修饰基因：kstF1，kstF2，kstF3，kstF4，kstF5，kstF6；共6个基因：

kstF1位于基因簇核苷酸序列第11773-12807位，编码邻氨基苯甲酸磷酸核糖转移酶，长度为344个氨基酸；

kstF2位于基因簇核苷酸序列第12800-13621位，编码色氨酸合成酶α亚基，长度为273个氨基酸；

kstF3位于基因簇核苷酸序列第15160-15855位，编码邻氨基苯甲酸磷酸核糖异构酶，长度为231个氨基酸；

kstF4位于基因簇核苷酸序列第15920-16618位，编码吲哚甘油-3-磷酶合成酶，长度为232个氨基酸；

kstF5位于基因簇核苷酸序列第54495-53452位，编码Enoyl还原酶，长度为347个氨基酸；

kstF6位于基因簇核苷酸序列第61849-63372位，编码羧化酶，长度为507个氨基酸；

5)抗性基因：kstRs1，kstRs2，kstRs3，kstRs4，kstRs5，kstRs6，kstRs7；共7个基因

kstRs1位于基因簇核苷酸序列第30224-31300位，编码ABC转运蛋白，长度为358个氨基酸；

kstRs2位于基因簇核苷酸序列第31297-32130位，编码ABC转运蛋白，长度为277个氨基酸；

kstRs3位于基因簇核苷酸序列第35584-34109位，编码外排蛋白，长度为491个氨基酸；

kstRs4位于基因簇核苷酸序列第36608-35625位，编码转运蛋白，长度为327个氨基酸；

kstRs5位于基因簇核苷酸序列第44236-47025位，编码SNF2/RAD54家族解螺旋酶，长度为929个氨基酸；

kstRs6位于基因簇核苷酸序列第47037-48338位，编码抗性蛋白，长度为433个氨基酸；

kstRs7位于基因簇核苷酸序列第57431-56853位，编码抗性蛋白，长度为192个氨基酸；

6)调节基因：kstRg1，kstRg2，kstRg3，kstRg4，kstRg5，共5个基因：

kgtRg1位于基因簇核苷酸序列第17553-16669位，编码转录激活因子，长度为294个氨基酸；

kgtRg2位于基因簇核苷酸序列第29233-30021位，编码转录调节因子，长度为262个氨基酸；

kgtRg3位于基因簇核苷酸序列第50317-49112位，编码调节因子，长度为401个氨基酸；

kgtRg4位于基因簇核苷酸序列第51422-51649位，编码调节因子，长度为75个氨基酸；

kgtRg5位于基因簇核苷酸序列第56007-56840位，编码调节因子，长度为277个氨基酸；

7)其他基因：kstU1，kstU2，kstU3；共3个：

kgtU1位于基因簇核苷酸序列第48388-48822位，编码未知功能蛋白，长度为144个氨基酸；

kgtU2位于基因簇核苷酸序列第50774-50304位，编码未知功能蛋白，长度为156个氨基酸；

kgtU3位于基因簇核苷酸序列第51216-50785位，编码未知功能蛋白，长度为143个氨基酸。