[发明专利]肺炎支原体P1-RFLP分型检测引物及方法有效
| 申请号: | 201210411702.X | 申请日: | 2012-10-25 |
| 公开(公告)号: | CN103031373A | 公开(公告)日: | 2013-04-10 |
| 发明(设计)人: | 孙红妹;薛冠华;李少丽;赵汉青;冯燕玲 | 申请(专利权)人: | 首都儿科研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京中伟智信专利商标代理事务所 11325 | 代理人: | 张岱 |
| 地址: | 100020*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 肺炎 支原体 p1 rflp 检测 引物 方法 | ||
1.一种肺炎支原体P1-RFLP分型检测引物,分析两个已知的Mp标准株M129和FH P1基因RepMP4和RepMP2/3序列,在序列的中间部位包含HaeIII酶切位点区域设计8条内套引物,其特征在于RepMP4序列的4条内套引物为上游引物ADH1in:ATTCTCATCCTCACCGCCA,下游引物ADH1M:CCTTGGGATCCAAGTGATCA以及上游引物ADH2M:TGATCACTTGGATCCCAAGG,下游引物ADH2in:CTGCTAACAATTCCGGATTGAG;RepMP2/3序列的4条内套引物为上游引物ADH3in:TTGCTGCTAACGAGTACGAG,下游引物ADH3M:CAAATCCCACACACTCTCCA以及下游引物ADH4in:TGACTGATACCTGTGCGG,上游引物ADH4M:TGGAGAGTGTGTGGGATTTG。
2.一种肺炎支原体P1-RFLP分型检测方法,其特征在于具体包括如下步骤:
(1)提取待测样本DNA;
(2)首先利用目前已发表的2对外套引物ADH1及ADH2、ADH3及ADH4,样本DNA及其它PCR组份构建PCR反应体系进行扩增,所述2对外套引物的序列分别为ADH1:CTGCCTTGTCCAAGTCCACT;ADH2:AACCTTGTCGGGAAGAGCTG;ADH3:CGAGTTTGCTGCTAACGAGT;ADH4:CTTGACTGATACCTGTGCGG;
其次利用权利要求1所述的8条内套引物、外套引物扩增后的产物DNA及其它PCR组份构建PCR反应体系进行内套引物扩增,其中外套引物物ADH1/ADH2扩增后的DNA,作为内套引物ADH1in/ADH1m和ADH2m/ADH2in的扩增模板,外套引物ADH3/ADH4扩增后的DNA,作为内套引物ADH3in/ADH3m和ADH4m/ADH4in的扩增模板;
(3)对上述PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,所有阳性产物混合后进行HaeIII酶切来判断型别。
3.根据权利要求2所述的一种肺炎支原体P1-RFLP分型检测方法,其特征在于所述的步骤(2)中的外套引物PCR反应体系为25μl:10×PCR reaction buffer2.5μl,25mM的MgCl2 2μl,2.5mM的dNTPs2μl,上游引物10μM1.5μl,下游引物10μM1.5μl,2.5U的Taq DNA polymerase1μl,DNA模板3μl、双蒸水11.5μl。
4.根据权利要求2所述的一种肺炎支原体P1-RFLP分型检测方法,其特征在于所述的步骤(2)中的内套引物PCR反应体系为25μl:10×PCR reaction buffer2.5μl,25mM的MgCl2 2μl,2.5mM的dNTPs2μl,上游引物10μM1.0μl,下游引物10μM1.0μl,2.5U的Taq DNA polymerase1μl,外套引物扩增后产物为DNA模板3μl、双蒸水12.5μl。
5.根据权利要求2所述的一种肺炎支原体P1-RFLP分型检测方法,其特征在于所述的步骤(3)中的外套引物PCR扩增条件为预变性94℃ 10min,接着94℃ 1min,55℃ 1min,72℃ 3min,30个循环,最后72℃延伸10min;内套引物PCR扩增条件为预变性94℃ 10min,接着94℃ 1min,55℃ 1min,72℃ 2min,30个循环,最后72℃延伸10min。
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