[发明专利]小黄鱼微卫星DNA分子标记

说明书

技术领域

本发明涉及一种分子标记技术，具体涉及一种小黄鱼微卫星DNA分子标记。

背景技术

小黄鱼（Larimichthys polyactis）隶属于鲈形目、石首鱼科、黄花鱼属，为广泛分布于渤海、黄海和东海北部的暖温性底层鱼类，是我国重要的海洋渔业经济种类，曾被誉为我国“四大渔业”之一。近些年来，高强度的捕捞压力已经使得小黄鱼资源处于过度捕捞状态。为了保护和管理小黄鱼渔业资源，研究其种群遗传结构和遗传变异水平是非常必要的。微卫星分子标记因具有多态性高、共显性等优点已经成为目前海水鱼类群体遗传分析最常用的手段。然而，迄今为止针对小黄鱼开发的微卫星分子标记只有35个（Chen等，Conservation genetics2009，10：1469-1471；Li等，Molecular Ecology Notes 2006，6(1)：188-190；Ma等，Genetics and Molecular Research 2011，10(3)：1455-1460），即使加上从近缘种如大黄鱼（Pseudosciaena crocea）和鮸鱼（Miichthys miiuy）筛选出可应用于小黄鱼的20个微卫星标记（Conservation genetics 2009，10:1629–1631；Genetics and Molecular Research 2012，11(2)：1469-1474），数量也是非常有限，亟待开发更多新的小黄鱼微卫星分子标记。

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于：开发小黄鱼微卫星DNA标记，提供多态性引物，建立小黄鱼微卫星标记开发的技术体系，为小黄鱼的遗传背景分析提供更多新的微卫星标记，弥补目前小黄鱼微卫星标记较为缺乏的不足。

本发明解决技术问题的技术方案：通过构建小黄鱼微卫星（GT）₁₇、（GGT）₉和（CTAT）₈富集文库，筛选小黄鱼多态性微卫星引物，以及对小黄鱼微卫星位点进行遗传多态性检测，开发了小黄鱼21个多态性丰富的微卫星标记。21个小黄鱼微卫星DNA分子标记的编号为：H5，H22，H26，H31，H33，H37，H38，H43，H44，H47，H51，H54，H65，H70，H71，H75，H80，H82，H84，H106，H111，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1，SEQ ID NO.2，SEQ ID NO.3，SEQ ID NO.4，SEQ ID NO.5，SEQ ID NO.6，SEQ ID NO.7，SEQ ID NO.8，SEQ ID NO.9，SEQ ID NO.10，SEQ ID NO.11，SEQ ID NO.12，SEQ ID NO.13，SEQ ID NO.14，SEQ ID NO.15，SEQ ID NO.16，SEQ ID NO.17，SEQ ID NO.18，SEQ ID NO.19，SEQ ID NO.20，SEQ ID NO.21所示。

21个微卫星标记H5，H22，H26，H31，H33，H37，H38，H43，H44，H47，H51，H54，H65，H70，H71，H75，H80，H82，H84，H106，H111的引物序列分别为：

小黄鱼（Larimichthys polyactis）microsatellite H5 primer sequence

H5-F:CTCAATGCTTCCAAATGCTG

H5-R:ATTTGACCCGAAGCTGAATG；

小黄鱼（Larimichthys polyactis）microsatellite H22 primer sequence

H22-F:TACGGCCTCTGTCTGTGAGA

H22-R:GAGAGGATGAGGGGAGGAGT；

小黄鱼（Larimichthys polyactis）microsatellite H26 primer sequence

H26-F:CCTCATCCTCTCTGCCTTTG

H26-R:ACGAATCAAACGCACCTTTT；

小黄鱼（Larimichthys polyactis）microsatellite H31 primer sequence

H31-F:CATTCACATTTTCCCCCAAC

H31-R:CCTGCTACTATGTGTGTGCGTA；