[发明专利]一种简单、快速提取柳枝稷组织总RNA的方法无效
| 申请号: | 201210131055.7 | 申请日: | 2012-05-02 |
| 公开(公告)号: | CN102690806A | 公开(公告)日: | 2012-09-26 |
| 发明(设计)人: | 杜道林;张欣;黄萍;薛永来;杨冉;田远飞 | 申请(专利权)人: | 江苏大学 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 楼高潮 |
| 地址: | 212013 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 简单 快速 提取 柳枝 组织 rna 方法 | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及植物的基因克隆、基因功能分析等分子生物学实验,具体涉及一种简单、快速提取植物组织总RNA的方法,适用于植物组织总RNA的提取。
背景技术
随着现代分子生物学的发展及其向各个学科的渗透,越来越多的分子水平技术被应用于植物的研究。如采用转基因技术增强植物的抗逆性,提高光合效率,增加生物学产量等。植物总RNA提取技术是一项植物分子生物学的基本实验技术,也是进行植物分子生物学方面研究的必要前提,对于功能基因组学以及遗传学研究具有重要意义。利用分离得到的纯度高、完整性好的高质量总RNA,才能用于Northern杂交,mRNA纯化、构建cDNA文库,通过RT-PCR分离基因以及进行蛋白质体外翻译等分子生物学实验操作。由于自然界和实验室都存在大量的RNA酶,因此RNA的提取产物极易降解,给实验带来较大的困难。因此如何快速提取RNA并防止RNA的降解而使之储存较长的时间,一直是分子生物学研究人员要解决的一个难题。尽管RNA的提取已经成为很成熟的技术,但在实际研究中经常很难做到顺利获得质量好的RNA。这归咎于很多因素,如材料保存不合理、器皿不洁净、操作不严等,造成RNA的降解。
有关植物RNA的提取方法较多,现有的方法主要有异硫氰酸胍法、SDS/酚法、CTAB-LiCL法等,这些方法已经被广泛用于许多植物组织总RNA的提取,但有一些植物组织中内含物极为复杂,尤其是在富含多糖、多酚、单宁及一些尚未能确定的次生代谢物等情况下,不利于RNA的分离纯化。这些方法在应用时均存在一定的缺陷,如提取时间长,提取所需的条件苛刻,提取率低,提取的总RNA完整性较差等缺点。然而,RNA质量的好坏,决定着实验结果的可信度高低。因此获取一种简单、快速的植物组织总RNA提取方法具有重要意义。
柳枝稷(英文名Switchgrass,拉丁名Panicum virgatumlinn),又称“能源草”,因其栽培技术简单,适应性广,防风固沙能力强,耐贫瘠,生物学产量高,被国际上确定为生产染料乙醇的首选生物能源植物,并投入了大量的人力、物力进行研究开发。其中,采用基因工程技术增加生物学产量,降低木质素含量和提高乙醇产率等方面已成为目前的研究热点之一。而高质量高纯度RNA的提取是生物技术的主要组成部分之一,在遗传转化体系的建立中具有十分重要的意义。柳枝稷因含纤维素及其他杂质较多,使其在提取RNA初期的研磨过程中较难研磨彻底,且耗费时间过长,影响柳枝稷RNA提取效率。
本发明提出的一种简单、快速提取植物组织总RNA方法,是植物进行转基因技术的重要前提。本发明的目的是要提供一种能使提取植物总RNA的时间更短、操作简单、成本低廉、提取效率更高的总RNA提取方法,是由以下方式实现的。首先在研磨过程中加入碳化钨研磨珠,使得研磨时间缩短,且研磨效果更好。其次总RNA提取液含有RNA酶的高效抑制剂、去垢剂、pH调节剂。高效抑制剂有异硫氰酸胍、水饱和酚,去垢剂为十二烷基肌氨酸钠,pH调节剂为NaAc缓冲液。该RNA提取液成本较低,且简便易得。本发明的总RNA提取方法包括样品研磨、核酸释放、氯仿抽提、异丙醇沉淀、清洗风干五步,提取过程简单,操作时间短(30-40min),经济有效,提取率高,提取的总RNA完整性好,适用于植物分子生物学操作。
发明内容
本发明的目的是提供一种简单、快速提取植物组织总RNA的方法,操作简单,提取时间短,重复性好,适用性强,能获得高质量、高浓度的RNA,为进一步分子生物学研究奠定了基础,结果准确有效。
本发明所提供的一种简单、快速提取柳枝稷组织总RNA的方法,按照下述步骤进行:
(1)样品研磨:取约0.5~1g新鲜的柳枝稷叶片或茎材料于研钵中,加入3mm碳化钨研磨珠3~5个,加入液氮后迅速研磨,重复数次直至磨成粉末,研磨时间控制在1min,将研磨后的粉末加入预冷的1.5mL EP管中;
(2)核酸释放:向步骤(1)中的离心管中加入1mL 配制好的RNA提取液,充分振荡,使其混合均匀,平行放置8-10min;
(3)氯仿抽提:12000~14000r/min离心5~8min,取上清液600~800微升转入新的1.5mL EP管中,加入预冷的250~300微升氯仿,在涡旋器上涡旋15s,使其充分混匀;
(4)异丙醇沉淀:12000~14000r/min离心8~10min,取上层水相200~300微升
转入新的1.5mL EP管中,加入200~300微升
异丙醇,上下颠倒数次;
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