[发明专利]一种检测黄牛PPARGC1A基因单核苷酸多态性的方法有效
| 申请号: | 201210124717.8 | 申请日: | 2012-04-25 |
| 公开(公告)号: | CN102888451A | 公开(公告)日: | 2013-01-23 |
| 发明(设计)人: | 陈宏;李密杰;刘梅;刘栋;蓝贤勇;雷初朝 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 712100 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 黄牛 ppargc1a 基因 核苷酸 多态性 方法 | ||
1.一种检测黄牛PPARGC1A基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,
(1)以包含PPARGC1A基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛PPARGC1A基因,
所述的引物对P为:
上游引物:5’-TCCTCTGTTTTACTGTCTTTG-3’
下游引物:5’-GTGCTTGGGGATTATTTTGG-3’;
(2)用琼脂糖凝胶电泳检测步骤(1)中PCR扩增产物片段大小;
(3)用变性剂处理步骤(1)中PCR扩增产物之后,再对变性后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛PPARGC1A基因第64897位的单核苷酸多态性。
2.如权利要求1所述的检测黄牛PPARGC1A基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,步骤(1)所述的PCR扩增反应程序为:
95℃预变性4min;94℃变性30s,51℃退火30s,72℃延伸30s,34个循环;72℃延伸10min。
3.如权利要求1所述的检测黄牛PPARGC1A基因的单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的琼脂糖凝胶电泳为质量浓度1.5%的琼脂糖凝胶电泳。
4.如权利要求1所述的检测黄牛PPARGC1A基因的单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述的聚丙烯酰胺凝胶电泳为质量浓度10%的聚丙烯酰胺凝胶电泳。
5.如权利要求1所述的检测黄牛PPARGC1A基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于,所述步骤(3)中根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛PPARGC1A基因第64897位的单核苷酸多态性为:GG基因型表现为64897位为核苷酸G纯合;GA基因型表现为64897位为核苷酸G/A杂合;AA基因型表现为64897位为核苷酸A纯和;其中,单核苷酸多态性AA基因型为突变纯合基因型。
6.权利要求1-5中任意一权利要求所述的检测黄牛PPARGC1A基因单核苷酸多态性的方法在鉴定不同黄牛群体多态性中的诊断应用。
7.权利要求6所述的应用,其特征在于用于中国黄牛肉用和生长性状的分子标记辅助选择中的应用。
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