[发明专利]一种二点委夜蛾的分子鉴定方法有效
申请号: | 201210101254.3 | 申请日: | 2012-04-10 |
公开(公告)号: | CN102605093A | 公开(公告)日: | 2012-07-25 |
发明(设计)人: | 朱彦彬;李志勇;白辉;董立;马继芳;李立涛;刘磊;董志平 | 申请(专利权)人: | 董志平 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
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地址: | 050035 河北省石家庄市*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 二点委 夜蛾 分子 鉴定 方法 | ||
1.一种二点委夜蛾种类的分子鉴定方法,其特征在于包括如下步骤:
(1) 收集昆虫样本:采集的样品放于95%乙醇中,-20℃保存;
(2)基因组DNA的提取:按照动物组织/细胞基因组快速提取试剂盒提取昆虫基因组DNA,保存于-20℃备用;
(3)COI基因的扩增、克隆、测序及序列分析,其中COI 基因序列的PCR 扩增引物: 上游引物/下游引物5-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3/5-TAAACTTGAGGGTGACCAAAAAATCA-3;
(4)测序结果表明ZB1~ZB17为二点委夜蛾不同单倍型,与ZB1(JQ395055)相似度均达到99%以上。
2.根据权利要求1所述的二点委夜蛾种类的分子鉴定方法,其特征在于COI基因扩增的具体步骤为:
20μL的PCR反应体系:PCR扩增总反应体系为20μL,其中模板DNA 2.0μL、上下游引物各1μL(浓度10μM)、10×PCR buffer 2.0μL、dNTP 1.6μL(2. 5 mM)、酶 0.3U、超纯水补足;
反应程序:94℃、5min;35个循环(94℃、45s,54℃、45s,72℃、1min);72℃延伸5min;用1%的琼脂糖凝胶电泳检测,并回收目的条带。
3.根据权利要求2所述的二点委夜蛾种类的分子鉴定方法,其特征在于
按照TaKaRa试剂盒上的步骤把切胶回收的PCR产物与PMD19-T载体连接,把阳性克隆的菌液测序。
4.根据权利要求3所述的二点委夜蛾种类的分子鉴定方法,其特征在于:
先利用Sequencher_v4.1.4软件读取测序的序列,观察峰值进行反复校对,利用DNAMAN_v6、ClustalX1.81软件对测得的序列与JQ395055所示的序列进行多序列同源比对;此外,根据MEGA5.05建树模型,以夜蛾科的小地老虎(Agrotis ipsilon)COI基因做为外群,用邻近法构建单倍型系统树,并利用p-distance计算各单倍型之间的遗传距离;结果表明与JQ395055相似度高达99%以上的即可认为该昆虫为二点委夜蛾。
5.将权利要求1所述的方法用于快速区分鉴别二点委夜蛾的用途。
6.一种用于鉴定二点委夜蛾种类的引物,其特征在于序列为:5-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3/5-TAAACTTGAGGGTGACCAAAAAATCA-3。
7.将权利要求5所述的引物用于鉴定二点委夜蛾种类的用途。
8.一种包含权利要求5所述引物的试剂盒。
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