[发明专利]SIRT6的调节物及其筛选分析有效

专利信息
申请号: 201180068116.3 申请日: 2011-12-21
公开(公告)号: CN103403553A 公开(公告)日: 2013-11-20
发明(设计)人: 林合宁 申请(专利权)人: 康奈尔大学
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;C07C225/06;C12Q1/34;A61K31/12;A61K31/131;G01N33/15
代理公司: 北京万慧达知识产权代理有限公司 11111 代理人: 白华胜;段晓玲
地址: 美国*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: sirt6 调节 及其 筛选 分析
【权利要求书】:

1.一种鉴定Sirt6、PfSir2a或Sirt7去酰基酶活性调节物的方法,所述方法包括:

在Sirt6、PfSir2a或Sirt7使底物去酰基的条件下,在存在候选化合物的情况下将酰基化的底物与Sirt6、PfSir2a或Sirt7接触以提供去酰基的底物,其中所述酰基化的底物含有酰基-赖氨酸部分和指示物部分,所述酰基含有至少三个通过碳-碳键连接的碳原子的烃基,其中所述烃基任选地包括一个选自O、N和S的杂原子,所述杂原子打断所述烃基的碳-碳键或者取代所述烃基中的碳原子,但是所述杂原子为OH、SH或NH2基团形式的不包括在内,并且其中在所述烃基中的一个或多个氢原子任选地被氟原子取代,以及其中所述赖氨酸的侧链ε-氨基丁基基团可以衍生化;

将去酰基的底物与裂解试剂接触,所述裂解试剂裂解所述赖氨酸和指示物部分之间的连接以释放所述指示物部分并产生具有信号强度的可检测信号;以及

将所述信号强度与Sirt6、PfSir2a或Sirt7去酰基酶活性相关联;

其中通过存在所述候选化合物的条件下的Sirt6、PfSir2a或Sirt7去酰基酶活性相对于不存在所述候选化合物的条件下的Sirt6、PfSir2a或Sirt7去酰基酶活性的变化,将所述候选化合物鉴定为Sirt6、PfSir2a或Sirt7去酰基酶活性的调节物。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述酰基-赖氨酸部分连接至至少一个其他的氨基酸,以及所述指示物部分通过肽键共价连接至所述赖氨酸或至少一个其他的氨基酸。

3.根据权利要求2所述的方法,其中所述裂解试剂是蛋白水解酶。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述指示物部分是荧光团。

5.根据权利要求4所述的方法,其中由于所述荧光团的裂解和释放,所述荧光团改变其发射波长。

6.根据权利要求1所述的方法,其中所述候选化合物具有下述化学结构:

其中R1是具有至少三个通过碳-碳键连接的碳原子的烃基,其中所述烃基任选地包括一个选自O、N和S的杂原子,所述杂原子打断所述烃基的碳-碳键或者取代所述烃基中的碳原子,但是所述杂原子为OH、SH或NH2基团形式的不包括在内,并且其中在所述烃基中的一个或多个氢原子任选地被氟原子取代;

R2选自S、NR6和O,其中R6是氢原子或烃基R;

X1、X2和X3独立地选自–(CH2)n–、–NR12–、-O-、-S-或键,其中R12是氢原子或烃基R,以及其中n表示1、2或3;

R5是氢原子或烃基R;

R3和R4独立地是氢原子或烃基R;

其中所述烃基R独立地为未取代的或者被一个或多个选自N、O、S、P和F的杂原子或含有一个或多个所述杂原子的杂原子基团所取代,其中R4可以是OH或SH。

7.根据权利要求6所述的方法,其中所述R1的烃基具有至少三个通过碳-碳键连接的碳原子且不存在杂原子取代,但是一个或多个氢原子任选地被氟原子所取代。

8.根据权利要求6所述的方法,其中所述R1的烃基具有至少6个通过碳-碳键连接的碳原子,其中所述烃基任选地包括一个选自O、N和S的杂原子,所述杂原子打断所述烃基的碳-碳键或者取代所述烃基中的碳原子,但是所述杂原子为OH、SH或NH2基团形式的不包括在内,以及其中在所述烃基中的一个或多个氢原子任选地被氟原子取代。

9.根据权利要求6所述的方法,其中所述R1的烃基具有至少7个通过碳-碳键连接的碳原子,其中所述烃基任选地包括一个选自O、N和S的杂原子,所述杂原子打断所述烃基的碳-碳键或者取代所述烃基中的碳原子,但是所述杂原子为OH、SH或NH2基团形式的不包括在内,以及其中在所述烃基中的一个或多个氢原子任选地被氟原子取代。

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