[发明专利]液滴中的碎片化的基因组DNA的分析

权利要求书

1.一种分析基因组DNA的方法，包括：

获得包含靶的基因组DNA；

有意地碎片化所述基因组DNA以产生碎片化的DNA；

使所述碎片化的DNA穿过至少一个液滴产生器以产生含有所述碎片化的DNA的含水液滴；以及

对所述液滴进行数码测定以确定所述靶的水平。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴具有小于约10纳升的平均体积。

3.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴包含每微升至少约5纳克浓度的所述基因组DNA。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述基因组DNA被布置在含水样品中，且其中所述液滴通过所述液滴产生器以每秒大于约50纳升的所述含水样品的流速被产生。

5.如权利要求1至4中任一项所述的方法，其中所述液滴以每秒至少约50颗液滴的液滴产生频率被产生。

6.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴具有小于约10纳升的平均体积且包含每微升至少约5纳克浓度的所述基因组DNA。

7.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴具有小于约10纳升的平均体积，且其中所述基因组DNA被布置在含水样品中，且其中所述液滴通过所述液滴产生器以每秒大于约50纳升的所述含水样品的流速被产生。

8.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴包含每微升至少约5纳克浓度的所述基因组DNA，且其中所述基因组DNA被布置在含水样品中，且其中所述液滴通过所述液滴产生器以每秒大于约50纳升的所述含水样品的流速被产生。

9.如权利要求6所述的方法，其中所述基因组DNA被布置在含水样品中，且其中所述液滴通过所述液滴产生器以每秒大于约50纳升的所述含水样品的流速被产生。

10.如权利要求6所述的方法，其中所述液滴以每秒至少约50颗液滴的液滴产生频率被产生。

11.如权利要求7所述的方法，其中所述液滴以每秒至少约50颗液滴的液滴产生频率被产生。

12.如权利要求8所述的方法，其中所述液滴以每秒至少约50颗液滴的液滴产生频率被产生。

13.如权利要求12所述的方法，其中所述液滴具有小于约10纳升的平均体积。

14.如权利要求1所述的方法，其中所述碎片化的步骤包括用限制酶消化所述基因组DNA的步骤。

15.如权利要求14所述的方法，其中所述限制酶以平均每千碱基小于约一次地切割所述基因组DNA。

16.如权利要求1所述的方法，其中所述碎片化的步骤包括剪切所述基因组DNA的步骤。

17.如权利要求1所述的方法，其中所述碎片化的步骤包括超声处理所述基因组DNA的步骤。

18.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴包含平均每颗液滴小于约2个拷贝的所述靶。

19.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴包含平均每颗液滴小于约2个所述基因组DNA的基因组等价物。

20.如权利要求1所述的方法，其中所述碎片化的步骤基本上不破坏所述靶。

21.如权利要求1所述的方法，其中所述进行数码测定的步骤包括扩增所述液滴中的所述靶的步骤。

22.如权利要求21所述的方法，其中所述靶通过PCR被扩增。

23.如权利要求21所述的方法，其中所述进行数码测定的步骤包括检测来自所述液滴的荧光的步骤。

24.如权利要求21到23中任一项所述的方法，其中所述进行数码测定的步骤包括用泊松算法确定所述靶的水平的步骤。

25.如权利要求1所述的方法，其中所述液滴具有约0.1到10纳升的平均体积。